项目说明:
RNA碱基修饰(RNA modifications),指核苷的碱基发生的化学修饰。现在最为普遍的碱基修饰以甲基化(m6A)的为主,涉及RNA稳定性、前体剪切、出核运转等功能。除m6A外,其它类型碱基修饰(m5C、m1A等)也在RNA中占有相当大的比例,已有研究表明其它类型碱基修饰同样有着重要的功能。
检测种类
图示不同类型的碱基修饰
通过RNA提取、酶解等步骤得到单核苷,通过LC-MS对常规核苷和碱基修饰核苷进行检测,得到修饰核苷种类和占对应正常核苷百分比的信息,目前可以检测包含m6A在内的10种碱基修饰核苷和4种常规碱基核苷。
检测平台
仪器: 液相色谱:Waters Acquity UPLC 质谱:AB API5500 QQQ –MS
应用领域
生物样本中代谢物的鉴定注释
疾病病理研究
Biomarker发掘
动、植物生长发育的研究
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