分子对接
 

       分子对接是通过受体的特征以及受体和药物分子之间的相互作用方式来进行药物设计的方法。
 
 

原理介绍

分子对接原理

       分子对接是根据受体和配体的结构特征，依据“锁-钥原理”和“酶-底物契合学说”，通过模拟分子间的几何结构和相互作用力，研究小分子与受体生物大分子之间的相互作用，寻找到小分子与受体活性部位的最适结合位置。

分子对接应用
 

1. 探究小分子药物与受体部位的相互作用机制
2. 通过数据库筛选出与靶点活性区域结合的先导药物
2. 通过对接结果解释药物分子产生活性的原因
3. 在分子水平上优化设计合理的优化药物分子结构

 

分子对接结果示例展示






服务内容
 

1. 模型构建
2. 受体(蛋白)模型处理
3. 受体(蛋白)活性区域确定
3. 配体模型处理
5. 分子对接
6. 结果分析与评价

 
 

案例文献


小分子与普氏立克次体甲硫氨酸氨肽酶和大肠杆菌甲硫氨酸氨肽酶的结合模型，其中绿色为底物分子。 

       文中利用Autodock软件，通过分子对接技术，在普氏立克次体的甲硫氨酸氨肽酶结构上对接了甲硫氨酸氨肽酶的抑制体结构模型，分析复合模型发现有17个组分可能抑制普氏立克次体的生长。并通过实验验证了分析的正确性。
       （Helgren TR,Chen C,Wangtrakuldee P,et al.Rickettsia prowazekii methionine aminopeptidase as a promising target for the development of antibacterial agents[J].Bioorganic & medicinal chemistry,2017,25(3):813-824.DOI:10.1016/j.bmc.2016.11.013）

 

服务特色
 

       HYY辉园苑-医云超算拥有专业的分子模拟和药物设计团队，在计算机模拟、结构能量计算的基础上，结合人工对于结合区域分子间相互作用力的判断，帮助客户找到真正合理的分子对接模型。