非标记定量蛋白质组学(label free)是近年来比较常见的一种对样本中蛋白质进行大规模相对定量分析的方法。
label free定量原理
以MS1为基础,计算每个峰在色谱上的面积,作为肽段信号强度的依据,从而实现样品间的相对定量。
a.软硬件先进(仪器为QE和QE PLUS和HF X,软件为MaxQuant);
b.质控严格(预实验中每个样本都需要进行蛋白质级别和预质谱级别的质检,不合格的给予合理建议。同时对仪器条件进行严格监控,发现不合格则重新开展实验,确保实验数据有效);
c.专业的团队(团队成员经验丰富,能处理几乎所有类型的样本分析);
d.强大的生信分析团队(除GO,KEGG等常规的分析外,还能进行IPA,趋势聚类,蛋白质相互作用以及其他个性化分析)。
吉凯基因成功案例:
1.Lonjon F, Turner M, Henry C, et al. Comparative secretome analysis of Ralstonia solanacearum Type 3 secretion-associated mutants reveals a fine control of effector delivery, essential for bacterial pathogenicity[J]. Molecular & Cellular Proteomics, 2016, 15(2): 598-613.
2.Jia X, Chen J, Megger D A, et al. Label-free proteomic analysis of exosomes derived from inducible hepatitis B virus-replicating HepAD38 cell line[J]. Molecular & Cellular Proteomics, 2017, 16(4 suppl 1): S144-S160.