第三代单分子动植物全基因组 De novo 测序
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第三代单分子动植物全基因组 De novo 测序

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产品描述

技术简介

基因组组装的难易程度是由基因组本身的结构决定的,主要包括基因组重复序列的长度及数量、基因组杂合程度、基因组大小、基因组 GC含量等因素。目前主流的二代测序平台产生的数据以及组装软件,还不能很好的处理复杂基因组的组装,而采用第二代与第三代测序技术相结合的基因组De novo测序策略,可以有效解决这一问题。将第三代单分子测序技术应用于动植物基因组de novo测序服务能有效解决二代测序方法所面临的高GC区域无法准确测定、高重复序列无法跨越、海量短序列组装困难等几大困扰。直接读取到的超长序列不仅给GC含量异常和高重复序列基因组组装提供了很好的帮助,而且能够大幅提高已有参考序列基因组的组装指标。基因组De novo测序结果再配合转录组测序数据对基因组进行注释,可得到更为精确的动植物基因组图谱。这不但令许多复杂基因组物种获得更精确的基因组参考序列,也为近缘物种的基因组差异分析提供了更好的解决方案。

 

基于PacBio单分子实时测序技术(SMRT)的三代测序,拥有超长测序读长、无PCR扩增偏好性、无GC偏好性等独特优势,组装结果中Contig N50/Scaffold N50/Assembly长度明显要长于二代测序短reads平台的组装结果。因此,三代测序已成为开展基因组De novo测序及基因组研究的重要趋势。

产品优势

zei高的N50组装指标

zei少的contig数量

极大提高复杂基因组的组装质量

 

可以获得超高精度的基因组图谱

样品要求

北京贝瑞和康生物技术有限公司

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