1．产品简介

原核转录组测序主要通过高通量测序研究原核生物特定组织或细胞在某个时期转录出来的mRNA。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点，通过新一代高通量测序，能够全面快速地获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。

2．生物信息分析内容

2.1  标准信息分析

1）     对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理；

2)        测序评估（比对统计、测序随机性评估、Reads在基因组上的分布）；

3)        统计rRNA去除效率（rRNA比例统计）；

4)        基因表达水平分析（对每个基因的表达量进行估计）；

5)        基因差异表达分析（两个或者两个以上的样本）；

6)        差异基因的 GO 富集分析（基于分析5）；

7)        差异基因的 KEGG 富集分析（基于分析5）；

8)        蛋白互作网络分析；

9)        SNP和InDel分析；

10)     预测新转录本及功能注释；

11)     UTR 注释及相关分析；

12)     Promoter 预测；

13)     反义转录本预测；

14)     sRNA分析。

2.2 定制化分析

   可结合客户需求，指定定制化分析内容

3．样品要求

1)        样品类型：去蛋白并进行DNase处理后的完整总RNA；

2)        样品需求量：Total RNA≥10 μg；

3)        样品浓度：≥200 ng/μl；

4)        样品纯度：OD260/280=1.8~2.2，OD260/2301.8~2.2，RIN≥6.0；23S:16S≥1.0。