极端环境微生物多样性分析

 

服务内容：

研究强碱、强盐、高热、低温、高压等极端环境中细菌、真菌、原核生物、真核生物等微生物多样性，提供整套研究方案，方案内容主要包括：“实验规划->样本采集->肠道微生物序列测定->生信统计学分析->论文协助”。

 

样品采集和保存：

可为客户提供相关的样品采集盒和样本保存液。

 

检测平台：

Illumina、Ion PGM、PacBio等高通量测序分析、PCR-DGGE等多种微生物多样性分析平台。

 

送样要求：

不同的样本类型，送样要求不一样。

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案例分析：

标题：北冰洋中心区新开水域微微型浮游植物优势地位分析

分析物种：微微型浮游植物

高通量测序平台：Roche 454

测序区域：18S V4区

主要实验结果：

　　微微型浮游植物为该海域的优势群落，可占叶绿素生物量的44%-80%。青绿藻、硅藻、蓝细菌、金藻及甲藻为鉴定出的主要光合浮游生物纲，分别占到微微型浮游植物的0–88%, 2–80%, 0–20%, 4–14% 及2–11%。其中真核生物的优势属（种）为塔胞藻Pyramimonas (Pyramimonas gelidicola), 微胞藻Micromonas (Micromonas pusilla) 及棕囊藻Phaeocystis。值得注意的是，高通量测序分析的结果表明，塔胞藻要比泛北冰洋优势种微胞藻的相对丰度高3倍；而Pyramimonas gelidicola也为第一优势种，要比一直认为的北冰洋夏季第一优势种Micromonas pusilla高1.5倍。典型相关性分析（CCA）结果表明：纬度和盐度是影响微微型浮游植物群落组成及分布的主要因素。

图1 微微型浮游植物的群落组成及环境因子分布的CCA展示图

图2 微微型浮游植物的群落组成（基于HPLC 色素分析及CHEMTAX方法）

原文链接：http://link.springer.com/article/10.1007/******/a>

参考文献：
(Zhang, He et al. 2015)Zhang, F., J. He, L. Lin and H. Jin (2015). "Dominance of picophytoplankton in the newly open surface water of the central Arctic Ocean." Polar Biology 38(7): 1081-1089.