宏转录组测序(Metatranscriptome),是指从整体水平上研究某一特定环境,特定时期群体生命全部基因组转录情况,以及转录调控规律的研究手段。相较于宏基因组,宏转录组可以从转录水平研究复杂微生物群落变化,更好的挖掘潜在的新基因。
技术流程
技术优势
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送样要求 RNA总量:RNA总量≥2ug RNA纯度:OD260/280在1.8-2.0之间,核酸完整无降解
分析示例
contig长度分布图
单样本物种分布饼图
多样本物种分布条形图
单样本COG功能分类统计图
Cazy分类统计图
抗生素抗性类型统计图
物种构成heatmap图(以Phylum分类水平为例)
差异基因可视化散点图及火山图
上下调差异基因GO注释柱形图
KEGG富集图