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(aCGH)比较基因组杂交芯片技术服务
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(aCGH)比较基因组杂交芯片技术服务
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上海康成生物工程有限公司

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aCGH 比较基因组杂交芯片/技术服务

        异常的DNA拷贝数变化(CNV)是许多人类疾病(如癌症、遗传性疾病、心血管疾病)的一种重要分子机制。作为疾病的一项生物标志,染色体水平的缺失、扩增等变化已成为许多疾病研究的热点,然而传统的方法(比如G显带,FISH,CGH等)存在操作繁琐,分辨率低等问题,难以提供变异区段的具体信息。

        基于芯片技术的比较基因组杂交(aCGH :array-based Comparative Genomic Hybridization)平台解决了上述问题。通过在一张芯片上用标记不同荧光素的样品(病例样品和对照样品)进行共杂交可检测样本基因组相对于对照基因组的DNA拷贝数变化(CNV),常用于肿瘤或遗传性疾病全基因组CNV检测,直观地表现出肿瘤及遗传性疾病基因组DNA在整个染色体组的缺失或扩增。对肿瘤而言缺失片段可能包含抑癌基因,而扩增片段则可能存在致癌基因。

        康成生物为您提供aCGH全程技术服务,并且拥有丰富的实验经验。您只需要提供保存完好的组织,细胞或石蜡样本,康成技术人员就能为您完成实验操作,包括样品超声打断基因组、荧光标记、芯片杂交、图像采集和数据分析等,并为您提供完整的实验报告。

Roche-NimbelGen CGH芯片产品
        Roche-NimbleGen的385K CGH芯片针对UCSCzei新数据库设计探针,覆盖了人,大鼠,小鼠的整个基因组。探针长度为50-75mer不等,可以确保Tm值均一化并且提供更好的信噪比和灵敏度。针对人的全基因组,Roche-NimbleGen新推出了2.1M超高密度aCGH芯片,单张芯片上有210万个覆盖全基因组的探针,探针平均间距缩小到1,169bp,可检测人基因组中约5kb大小的拷贝数变异,以外显子水平的分辨率对目标区域进行分析。除了覆盖人类全基因组不同规格的产品之外,Roche-NimbleGen还推出了覆盖人类单条染色体和针对人类基因外显子的芯片,便于不同需求的客户根据自身的需求选择合适的产品。利用Roche-NimbleGen CGH芯片平台已发表了多篇高质量论文,被收录在Nature,Science等顶级科技期刊中。


 

Roche-NimbleGen还提供多个物种的CGH芯片,物种包括:鸡,牛,狗,果蝇,线虫,疟原虫,恒河猴,斑马鱼,酿酒酵母,啤酒酵母。

康成生物aCGH技术服务主要实验流程
1. 样品超声打断基因组
待测样品(Test)和对照样品(Reference)基因组DNA样本超声剪切成低分子量片段;
2. 荧光标记
对Test(Cy5)和Reference(Cy3) DNA样品进行标记。
3. 芯片杂交
标记后的Test 和Reference DNA样品混合、变性后与CGH芯片进行共杂交。
4. 图像采集和数据分析
使用芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数值型数据保存,使用专业商用分析软件对原始数据进行分析运算;
5. 提供实验报告 包括详细的实验方法和芯片实验数据和图表:
芯片扫描图: Cy3、Cy5荧光扫描图像;
原始数据:探针的荧光信号强度原始数据。
拷贝数发生变化的染色体区段报告:用专业软件分析所有拷贝数发生变化的区段(CNV)的染色体定位和变化倍数以及相关基因信息。
 

 

上海康成生物工程有限公司
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