细胞株的误识别或污染，将对实验结果有很大的影响。 因此，推荐定期实施细胞株鉴定(Cell Line Authentication: CLA)，并确认无外来细胞的混入或置换。 在CLA中，广泛使用对STR(Short Tandem Repeat)进行分析的方法。 STR是散布在基因组中的以2-7个碱基短串联重复序列。 不同个体间的STR的重复次数（等位基因）各不相同，因此STR是DNA鉴定中很有用的标记。 在CLA中首先用PCR扩增多个STR后，通过毛细管电泳鉴定每个等位基因。 然后，将已鉴定的等位基因与在ATCC(American Type Culture Collection)等生物资源中心注册的各个的等位基因（以下，标记为参考等位基因）相比较而鉴定细胞株（1）。 此时，为了获取高可靠性的结果，仪器需要具有高分析性能。

在此，介绍使用DS3000 Compact CE Sequencer (以下简称DS3000)时的CLA实例。 用GenePrint® 10 System与GenePrint® 24 System (Promega®)验证的结果，以DS3000获取的等位基因与参考等位基因的一致程度为大于等于80%时，将其判断为相同细胞（2）。 由此可知，DS3000具有可进行CLA的分析性能。