简介 

基于图像的表型分析方法，如广泛使用的 Cell Painting  分析，使用高内涵成像和多参数输出来研究细胞中的生 物、遗传和化学扰动。这种日益流行的方法正被应用于从 药物发现项目到基因组筛选研究。

在标准的 Cell Painting 实验中，各种细胞器和结构 ( 细 胞核、细胞质、线粒体、高尔基体、内质网、细胞骨架、胞 质 RNA 和核仁 ) 在 5 个成像通道中被采集。这种广泛的 细胞染色能够以单细胞分辨率对多种形态的扰动进行监 测和定量。已发表的 Cell Painting 分析的局限性包括适 合的染料可用性狭窄以及成像系统提供足够的光谱分离 能力。具体来说，高尔基体和肌动蛋白是通过同一通道成 像的，这就给图像分析中区分这两个结构带来了挑战。这 种限制可能会干扰 hit 的选择或掩盖某些化合物的效果， 特别是那些具有影响高尔基体 ( 生物合成途径 ) 或细胞骨 架网络的作用机制 (MOA) 的化合物。