大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。今天跟大家介绍一下易基因的王牌技术:微量cfDNA简化基因组甲基化测序(cfDNA-RBS)。
cfDNA片段化严重,片段大小常在150bp左右,现有甲基化检测技术包括cfMeDIP和微量WGBS等。无法做到碱基分辨、具有抗体特异性和非特异性捕获、覆盖深度低、检测成本高等特点。常规RRBS富集约70-350bp范围酶切片段,如对于CG含量高的片段将被切割的更碎而无法检测,保留下来的片段反而是CG含量低,无甲基化信息的基因片段。
易基因研发cfDNA-RBS技术,特异性捕获CCGG位点两端的DNA,通过亚硫酸盐测序,实现高深度,单碱基分辨检测CG位点甲基化信息。DNA起始量仅需5ng,是目前肿瘤甲基化标志物检测研究的优选技术,应用场景包括肿瘤早筛、肿瘤诊断、个性化用药、实时监控、预后监测等。
应用场景:
癌前病变的癌变预警标志物检测
肿瘤早期筛查标志物检测
肿瘤预后标志物检测
药物疗效预测标志物检测
技术优势:
超低起始量:100-500ul血浆或5ng cfDNA;
测序覆盖度高:20G测序数据,可达10M的CG位点覆盖,涵盖CpG岛、启动子、增强子、CTCF结合位点等多种核心调控区域
单碱基分辨率:在其覆盖范围内可精确分析每一个C碱基的甲基化状态;
性价比高:成本相对于现有技术大幅降低。
技术路线: