Ion Torrent Genexus...

Ion Torrent Genexus高通量测序系统技术特点

参考成交价格: 200~300万元[人民币]
技术特点

【技术特点】-- Ion Torrent Genexus高通量测序系统


Ion Torrent Genexus集成化测序仪是Ion Torrent Genexus System系统的一部分。它是第一套完全整合的高通量基因测序平台。它拥有高度自动化的工作流程,一天之内即可由样本生成报告。Genexus集成化测序仪可以作为一个独立的仪器,在一个单独的平台上自动执行NGS文库准备、测序和分析。

新的多通道Ion Torrent GX5芯片设计,支持变化的样本摄入量,因此您可以经济高效地处理样品。

Genexus集成化测序仪的创新点

  • 自动化流程—文库准备、测序和分析都在一个仪器上进行,该仪器采用了一体化的工作流程

  • 简单的分析流程—不需要服务器,集成报告功能将在2020年整合到仪器中

  • 简单的操作—通过预置试剂和预先设定的仪器运行流程,只需一个按键和五分钟的手动操作时间即可完成工作

  • 快速周转—从生物样本到生成报告仅需一天。

  • 通量灵活,无需攒样—在机试剂和芯片的稳定性可支持样本摄入量的可变性

  • 可视化操作界面—了解试剂的放置情况和通过自动条形码扫描检测错误

  • 由经过FDA注册和ISO 13485认证的工厂生产–仪器质量有保障

  • 创新的多通道芯片—在一次运行中同时处理多达四种可兼容的测试。


上市时间:2021年10月
Ion Torrent Genexus系统是行业内第一个真正落地实现 “All in One,One for All” 理念的高通量二代测序(NGS)系统,由纯化系统、一体化测序仪和软件组成,极具创新性地将NGS全部湿实验和干实验,及全流程硬件系统和软件系统实现一体化。只需2步、15分钟的手动操作和设置,1~32个样本通量,最快一天完成NGS全流程。


Ion TorrentTM GenexusTM系统由Genexus纯化系统、Genexus一体化测序仪和Genexus软件组成,极具创新性地将NGS全部湿实验和干实验,及全流程硬件系统和软件系统实现一体化。

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自动化程度高

只需两台仪器,即可将整个流程从样本核酸提取、纯化、定量、稀释,到文库构建、模板制备、测序,再到数据质控、分析、变异查找、注释、报告出具的诸多步骤实现自动化操作。全程仅需2步人工操作,极大程度减少了人工干预。

一体化程度高

创新性地将核酸提取设备、纯化设备、定量设备、移液设备、视觉监控设备、温控设备、文库构建设备、模板制备设备、二代测序主机、基础分析软件、数据和报告服务器,众多硬件设备和软件集成一体,引领行业发展。

可及性强

简单易用的系统,全流程只需2步、15分钟的手动操作和设置。所有试剂预装且耗材配有条形码,即拆即用,机载智能化视觉追踪反馈系统实时监控耗材情况,具有防错保护功能。全程由一个操作简便的软件控制,只需快速的4步设定。1~32个样本通量,最快一天完成NGS全流程,灵活高效。Genexus系统兼具“智慧大脑” 和“发达四肢”,即便是没有NGS经验的人员,也能迅速开展NGS项目。

拓展性强

广泛的应用范围,可用于肿瘤、微生物与感染性疾病、生殖遗传领域相关检测,以及更多领域的转化研究应用。借助Ion AmpliSeqTM核心技术,可为人类和其他各物种自由灵活定制各种基因检测Panel,提供一站式解决方案。

兼容性强

兼容丰富的样本类型,包括FFPE、全血、血浆、新鲜组织、冷冻组织、外周血白细胞等。

周转时间快

检测速度快,最快只需一天即可获得最终变异检测报告。

准确性高

目前,采用Ion Torrent技术已发表的原创研究文献已超过10,000多篇,国内外诸多研究和实践均证明Ion Torrent技术和Ion AmpliSeq方法的准确性和可靠性。

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Ion Torrent Genexus 集成测序仪是 Ion Torrent Genexus 系统的一部分,该系统是首款交钥匙的下一代测序 (NGS) 解决方案,可自动执行样本到报告工作流程,并在一天内交付结果。


Genexus 集成测序仪自动执行目标 NGS 工作流程的所有步骤,从纯化和定量核酸开始。Genexus 测序仪只需一个接触点和五分钟的动手时间,即可自动完成 NGS 库制备(包括 cDNA 合成)、模板制备、测序、初级数据分析以及 DNA、RNA 和 cfTNA 应用的变异报告。Genexus 测序仪在四通道半导体芯片上完成:Ion Torrent GX5 芯片。GX5 芯片的四个通道中的每一个都支持 1200 万到 1500 万次读取的输出,并且可根据吞吐量需求单独或全部使用。Ion Torrent Genexus 软件通过将设置到报告工作流集成到单个软件生态系统中,简化了 NGS 工作流。


• 在一天内快速从核酸到报告

• 通过单一仪器简化 NGS 工作流程,该仪器可自动执行库准备、排序和分析,包括变体调用

• 调整运行设置,因为样本具有多路复用的灵活性,每次运行最多 32 个库反应,增量为 4 个

• 使用四通道 GX5 芯片同时创建库并序列多达四种不同的检测

• 使用预填充试剂、单一接触点和五分钟的动手时间简化设置,从而降低 NGS 运营成本

• 通过允许 Genexus 定序器的板载视觉系统验证试剂放置并实时检测错误,防止用户错误

• 减轻检测采用和测试新软件版本的负担,同时使用 Genexus 软件保留以前的版本


体验内部 NGS 精致

如今,许多实验室在内部执行 NGS,或考虑在未来采用内部 NGS 时,都面临着重大挑战和障碍。对于许多临床研究实验室来说,现有的 NGS 工作流程可能很慢、复杂且成本高昂。这些工作流程以及将样品外包给外部实验室可能需要数周时间才能得到结果,这可能会延迟答案。工作流程的复杂性、高昂的运营成本和较长的周转时间是考虑内部 NGS 的实验室的障碍,并限制了实验室利用下一代测序功能的方式。


Genexus 集成序列器有助于在实验室内部实施 NGS 的方式上实现范式转变。使用 Ion AmpliSeq 和 Ion AmpliSeq HD 技术进行库准备,通过等温放大进行模板制备,以及半导体测序均在 Genexus 集成序列器上实现自动化,从而实现从手关闭核酸到报告工作流在一天内。Genexus 测序仪的用户能够生成和提供一个全面的分子配置文件,用于每周的每一天对样本进行测序。


通过 Genexus 集成序列仪的多项关键创新,降低了复杂性。从核酸到变体报告,从自动操作工作流从使用 Genexus 软件进行运行规划开始。在运行规划期间,用户可以选择所需的示例和检测,并使用设置向导为序列器创建运行计划。在需要五分钟动手时间的定序器设置期间,板载视觉系统使用条形码和 RFID 检测实时验证易损件安装,确保在运行开始前进行适当的设置。运行完成后,用户可以查看每个样本的集成变体报告、样本级质量控制指标以及使用的试剂列表。


考虑采用测定方法的新方法

Genexus 软件除了通过将运行规划到变体报告的所有步骤集成到单个软件生态系统中来简化 NGS 工作流外,还通过容器化测定设计文件、算法和UI 功能到自给自足的包中。同一版本的软件可以同时支持多个检测,允许用户保留以前实现的工作流,同时优化新的检测工作流。软件更新将不那么频繁,因为新的检测可以安装为一个独立的应用程序。 Genexus软件为用户提供了优化新检测的灵活性,同时在单个Genexus集成序列器上运行已经实现的检测,无需测试环境中的多种仪器。





【技术特点对用户带来的好处】-- Ion Torrent Genexus高通量测序系统


【典型应用举例】-- Ion Torrent Genexus高通量测序系统


【产品所获奖项】-- Ion Torrent Genexus高通量测序系统



在11月8日第二届进博会展示发布平台上,科学服务领域的世界领导者——赛默飞世尔科技(以下简称赛默飞)发布了其全球首款能在一天内自动完成样本制备到结果报告流程的高通量基因测序(NGS)平台——Ion Torrent™ Genexus™系统,并发布了配套的Oncomine™ Precision Assay泛癌种试剂盒。

  作为赛默飞全球第一套完全整合的高通量基因测序(NGS)平台,Ion Torrent™ Genexus™系统提供了一天内、一站式的自动化整体解决方案,重新定义了基因组分析模式,为精准医学在临床中的进一步普及提供了可能。该平台实现了仅需要少量样本,就可以在一天内自动且经济有效地完成从样本到报告的完整基因测序流程。未来,该系统将助力更多医院自建NGS检测平台,帮助癌症等患者快速得到及时和全面的检测结果,更好地指导靶向治疗方案选择,提升治疗效果,改善患者预后。

Ion Torrent™ Genexus™系统

  “两届进博会都为我们企业新品首发、供需对接搭建了非常好的平台,这也是为什么我们会选择第二届进博会发布Ion Torrent™ Genexus™系统的原因。”赛默飞中国区总裁艾礼德(Tony Acciarito)表示:“我们希望通过一系列赛默飞前沿科技的发布,推进精准医学在临床中的应用,惠及更多中国患者,助力‘健康中国2030’目标的实现。”


近日,赛默飞世尔科技在美国发布了Ion Torrent Genexus系统,这是第一套完全整合的高通量基因测序 (NGS) 平台,其特色为能够在一天内自动且经济有效地完成标本到报告的全流程。这套一站式解决方案于2019年分子病理年会(AMP)发布,它重新定义了基因组分析模式,未来可让更多医院建立NGS检测平台。


赛默飞还同步发布了Oncomine Precision Assay试剂盒*,这是一种创新的、能够在Genexus平台使用的泛癌种试剂盒,同一试剂盒适用于福尔马林固定石蜡包埋的组织样本和液体活检样本并进行全面的基因信息分析。


赛默飞世尔科技首席运营官马克•史蒂文森(Mark Stevenson)表示:“我们的愿景是帮助医务人员在各种临床场景中充分利用全面的基因组信息来提升精准医疗水平。我们可以预见,不久的将来本地医院的患者都可以得到及时和全面的检测结果,而这些结果可以更好地指导靶向治疗方案的选择,并提升治疗效果。”


目前,大多数患者仍然会在本地医院接受治疗。最近发表于Clinical Lung Cancer1的研究强调,由于检测样本外送物流带来的挑战限制了医院,使他们无法在当天即利用NGS的全面的基因检测。因为技术复杂,成本高昂,大多数当地分子实验室无法直接采用NGS平台,只能依赖于有限的单基因检测,而单基因检测无法提供肿瘤的全面基因信息,一些实验室选择外送样本做NGS分析。

目前,外送样本到独立医学实验室利用现有市场上的NGS平台进行检测,主要受到两个问题的困扰:如一篇Cancers2文献中强调的那样,最终检测结果往往需要几周的时间,同时需要较高的样本起始量。严苛的起始样品要求往往导致样本起始量不足(QNS)的报告,这意味着最终检测结果的不确定性。今年发表的“癌症临床研究3-6”显示,QNS报告比率在17- 23%之间,这还不包括因未能通过样本质量检测标准而没提交的样本。这些问题往往影响及时的治疗决策,并可能导致临床效果不佳。


快速周转和自动化

Genexus系统树立了新的典范。它的快速周转和自动化流程可大大降低人为干预和潜在的人为错误。该系统仅需少量样本,可节约成本处理小批量样本,并可在一天内提供全面报告。这些特点可以在未来帮助分子病理学家将NGS的结果信息和一线检测方法(比如免疫组化)做并行分析。


波尔图大学分子病理和免疫研究所的首席研究员Jose Luis Costa博士参加了该系统的早期测试,他评价说:“该系统的速度令人惊讶,不过对我而言,它更大的价值是如此便捷易用。原先认为NGS复杂困难而无法采用NGS平台的客户会发现Genexus系统极大地降低了NGS的复杂性。这是第一台可以完成从生物样本到报告全流程的系统,而全程几乎无需操作人员的介入。”


基于创新的芯片设计,实验室人员可以经济、灵活地调整检测通量以便及时检测送到实验室的少批量样本。Genexus系统包括:Genexus整合测序仪,Genexus纯化系统和机载报告软件。生产Genexus系统和相关试剂的工厂符合ISO13485标准,并于美国FDA注册登记。赛默飞计划为Genexus系统申请FDA审批,以加速包括肿瘤和其它临床应用在内的诊断试剂的开发。


同一试剂盒适用实体组织和液体活检肿瘤样本的生物标记物检测

Oncomine Precision Assay试剂盒可适用于检测福尔马林固定石蜡包埋样本和液体活检样本,并最大化地检测相关生物标记物(比如EGFR, ALK, KRAS, BRAF, ROS1, NTRK, RET, HER2, ERBB2等),如与Genexus系统配合使用,分子检测实验室将可以在和单基因检测所耗相同的时间内获得全面的NGS结果。这款试剂盒是配套Genexus在肿瘤研究和其它应用研究(例如感染性疾病、遗传病和生殖健康)领域内发布的首个产品。


日本AI医院项目(一项在日本全国范围内利用NGS和qPCR仪研究液体活检的项目)总监Yusuke Nakemura认为:Genexus系统带来的进步是过去二十年来NGS测序取得重大进展的典型例子。新系统全面的自动化特征将改变癌症研究和临床管理,并使得NGS检测在分散到各地的实验室中得到更广泛的应用。




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