免疫共沉淀（Co-Immunoprecipitation，CoIP）是一项基于抗体特异性识别特定抗原的这一原理研究蛋白质相互作用的经典方法。免疫共沉淀常用于检验生理状态下蛋白质间的相互作用，通过与质谱（MS）联用可以用于鉴定发现新的相互作用蛋白。百泰派克利用SILAC方法分别标记实验组和对照组细胞后进行Co-IP实验，依靠抗原与抗体之间的专一性反应分离得到免疫复合物；再通过LC-MS/MS来定性/定量检测免疫复合物中的蛋白；当实验组与对照组中某个蛋白质的含量达到统计学差异时，判定这个蛋白质与研究的蛋白具有相互作用，可极大降低蛋白质互作假阳性结果可能性。SILAC技术和Co-IP-MS技术结合可用于高通量定量分析在特定情况下蛋白的互作蛋白网。

SILAC 的联用从源头引入质量差异，降低了实验系统误差，定量信息丰富，准确度高。百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台，Orbitrap Fusion质谱平台，Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，推出SILAC与免疫共沉淀质谱联用的蛋白互作分析服务技术包裹（SILAC-based CoIP-MS），您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的细胞寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、抗体IP、效率检测、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

SILAC-based CoIP-MS实验流程