SILAC定量蛋白组分析参数指标

基于SILAC/Dimethyl标记的定量蛋白组分析

SILAC是细胞培养条件下稳定同位素标记技术(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture, SILAC)的简称。SILAC实验流程是：细胞培养基中加入轻、中或重型稳定同位素标记的必需氨基酸赖氨酸(Lys)和精氨酸(Arg)，在细胞生长过程中使新合成的蛋白会带上稳定同位素标签。等量混合各类型蛋白质,酶解后进行质谱分析。通过比较一级质谱图中不带标记/带同位素标记质谱峰型的面积大小进行相对定量，同时二级谱图对肽段进行序列测定从而进行蛋白鉴定。与SILAC类似，二甲基Dimethyl标记也是一种同位素蛋白标记的方法。Dimethyl是一种小分子同位素化学标记物，通过化学标记的方法标记细胞裂解后的蛋白或多肽的N端或者赖氨酸的ε氨基基团，使蛋白／多肽标记上不同的Dimethyl标签。除了标记方法的差别外，SILAC/Dimethyl两种标记的质谱分析方法基本一致，而且具有相近的分析精度和广度，在定量蛋白组学分析研究中受到越来越广泛的运用。

百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF质谱平台，Orbitrap Fusion质谱平台，Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，推出基于SILAC/Dimethyl的定量蛋白组分析服务技术包裹，您只需要将您的实验目的告诉我们并将您的细胞寄给我们，我们会负责项目后续所有事宜，包括细胞培养、细胞标记、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分离、质谱分析、质谱原始数据分析、生物信息学分析。

SILAC定量蛋白组学实验流程