产品 | 货号 |
NextSeq 550Dx仪器 | 20005715 |
NextSeq 550Dx高输出试剂盒v2(300个循环)a | 20019554 |
NextSeq 550Dx高输出试剂盒v2.5(300个循环)a | 20028871 |
TruSeq定制扩增子试剂盒Dx a | 20005718 |
TruSeq Custom Amplicon Dx-FFPE QC试剂盒a | 20006259 |
NextSeq空气过滤器 | 20022240 |
一种。I类测序消耗品具有单批装运,套件批测试,提前更改通知和每批可用的分析证书。试剂是根据设计控制原则开发的,并根据当前的良好生产规范(cGMP)生产,并经过验证以确保符合规范。 |
参数 | 规格 |
---|---|
仪器配置 | RFID消耗品跟踪 |
仪器控制计算机 | 处理器:双英特尔®至强® E5-2648L V3 1.8 GHz CPU,内存:128 GB 硬盘驱动器,DX模式:2 ' 2 TB(RAID 1) 硬盘驱动器,研究模式:2 ' 2 TB(RAID 1) 作业系统:Windows 10 |
操作环境 | 温度:19°C至25°C(22°C±3°C) 湿度:非冷凝20%–80%相对湿度 海拔:0-2000 m(6500 ft) 通风:600 W时高达2048 BTU /小时 只能在室内使用 |
发光二极管(LED) | 520 nm,650 nm;激光二极管:780 nm,IIIb级 |
方面 | 宽×深×高:54厘米×69厘米×58厘米 重量:186磅,板条箱重量:360磅 |
电源要求 | 100–120 VAC 15 A,220–240 VAC 10 A |
射频识别器(RFID) | 频率:13.56 MHz 功率:电源电流120 mA,RF输出功率200 mW |
产品安全与合规 | NRTL认证的IEC 61010-1 CE认证 通过FCC / IC认证 |
参考招标参数
中国医学科学院北京协和医院转化医学国家重大 科技基础设施项目(第一批) 招标编号:0701-224106070112
第 3 包 品目 3-1 高通量基因测序仪
数量 1 套,每套技术需求如下:
1 测序通量及应用
1.1 需提供单次测序单晶片可产生≥120G 碱基数据的测序仪;
1.2 涵盖人类医学外显子组测序、全外显子组测序、宏基因组测序、靶向重测序、转录组测序、单
细胞测序等测序需求:
1.2.1 仪器可实现全外显子组测序(WES,指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域 DNA 捕捉并富
集后进行高通量测序的基因组分析方法)
1.2.2 仪器兼容细胞遗传学,甲基化芯片检测
1.2.3 仪器可实现宏基因组测序(mNGS,是指对微生物群体进行高通量测序,分析特定环境中微生
物群体基因组成及功能、微生物群体的多样性与丰度,进而分析微生物与环境、微生物与宿主之间
的关系,发现具有特定功能的基因)
1.2.4 仪器可实现靶向基因重测序(Targeted Re-sequencing)采用基于多重 PCR 扩增或者探针杂
交捕获技术获取靶向目标区域,用相对少的数据量实现目标区域的深度测序;可应用于肿瘤、遗传
病等领域
1.2.5 仪器可实现转录组测序(RNASeq,是指对细胞内所有转录产物的集合,包括信使 RNA、核糖
体 RNA、转运 RNA 及非编码 RNA 进行测序)
2 测序及光学系统
2.1 仪器测序原理为 SBS 边合成边测序技术
2.2 仪器支持单端和双端测序,支持单端序列标签和双端序列标签测序
2.3 测序质量 Q30 等信息实时显示
2.4 单次运行可产出≥400M 个序列的测序信息
2.5 单次运行可生成≥120G 碱基数据
2.6 单条脱氧核糖核苷酸序列最大读取量: 300 个碱基(2×150bp)
2.7 双面成像能处理流动槽上表面和下表面的簇
3 芯片扫描系统
3.1 仪器兼容芯片扫描功能
3.2 配套软件能够分析以芯片为基础的分子细胞遗传学和 IVF 数据,变异类型包括拷贝数变异,杂
合性缺失,单亲二倍体,微缺失微重复,部分单基因病,低水平嵌合等,内置标准分析流程支持二
联体、三联体分析模式
4 软件与控制系统
4.1. 具备仪器控制计算机:
4.1.1 高性能处理器
4.1.2 内存:≥128 GB
4.1.3 硬盘:具有 RUO,IVD 两个工作模块,RUO/IVD 分别 2 TB SSD
4.1.4 操作系统:Win10
5 硬件与环境
5.1 仪器长宽高不超过 54 cm × 69 cm × 58 cm
5.2 仪器重量≤85 公斤
5.3 具备 USB 接口≥ 3 个,可链接网络带宽
5.4 触摸屏显示器,可利用控制界面,直接进行仪器设置以及测序参数设置
▲5.5 具备空气过滤舱,内置可更换空气滤片
6 系统软件
▲6.1 具备仪器自检功能:包括运动装置检查;光学检查,流路检查和温度检查
6.2 具备仪器控制系统;
6.3 具备实时图像分析和碱基检出系统;
6.4 具备数据传输软件;
▲6.5 本地运行管理器:选择本项,启动本地运行管理器来创建运行,监视运行状态,分析测序数
据和查看结果
6.5.1 软件可作为仪器计算机上的一项服务运行,与仪器操作软件整合
6.5.2 具备记录待测序样本功能
6.5.3 软件可提供分析模块的特定运行设置界面
6.5.4 执行所选分析模块的一系列特定分析步骤
6.5.5 完成分析后,以表格和图形的形式显示分析结果
7 生信分析系统
7.1 在测序过程中,相关软件将进行实时图像分析、碱基检出以及不同样本间的数据拆分
7.2 测序结束可即刻自动在测序仪上进行二级分析
▲7.3 包含 IVD 固定分析模块以下通用基因组二级分析模块:小 RNA 分析、扩增子分析、重测序分
析和 fastq 文件生成等
▲8 测序数据质控
8.1 诊断模式下 75 cycles Q30≥80%,300 cycles Q30≥75%
8.2 科研模式下 Q30≥70%
9 测序时间(簇生成+测序时间)
9.1 平均簇生成时间:2.5 小时
9.2 平均每个循环所需时间:≤5 分钟
9.4 产生 120Gb 数据:诊断模式≤35 个小时,科研模式≤29 个小时
10 仪器应用 10.1 单次测序可完成≥20 个不超过 20M 的宏基因组测序
10.2 单次测序可完成≥10-12 个外显子组测序
10.3 单次测序可完成 10 转录组测序
11 安全要求
▲11.1 至少有 3 个账号使用层级,以支持分级管理(由本地运行管理-Local Run Manager 实现)
11.2 内置仪器状态和错误检测传感器
11.3 测序完成后,废液可流回试剂卡盒以便处理
12 售后要求 12.1 提供设备装箱单及本次投标装备配置清单
12.2 仪器到货后,公司工程师在一周内到现场开箱验货,完成联机安装调试及基本操作培训
12.3 卖方提供免费的操作及维护培训
12.4 提供的现场免费安装、调试设备,进行操作试验,直至运行正常
12.5 厂家直接提供技术服务,设备出现故障时保证 24 小时内服务维修响应
12.6 测序控制软件免费升级
▲12.7 质量保证期:设备验收合格后 3 年
13.高通量测序仪配置清单
13.1 主机 1 台
13.2 主机附件箱 1 套
13.3 电源线 1 套
13.4 滤板、适配器 1 套
13.5 数据分析加速