中心拥有液相色谱四级杆飞行时间串联质谱仪、同位素质谱仪、全自动微生物鉴定及药敏分析系统、致病菌筛选系统等一批具有国际先进水平的检测设备，进口设备占90%以上，并建有生物安全二级(PⅡ)、转基因食品检测实验室。