上海市能源作物育种及应用重点实验室依托于上海大学，于2005年10月经上海市科委批准成立，主要致力于能源作物新种质的育种研究。2007年底通过科委建设验收，并在2008年通过了重点实验室评估。

　　 本实验室针对我国发展能源作物的迫切需求与可用土地资源严重短缺的矛盾，设以下五个研究方向：抗逆基因的分离与鉴定；能源作物储藏物质代谢和调控研究；能源作物新种质培育；生物能源转化和利用；环境生态修复研究。是上海地区仅有的专业从事能源作物育种研究的科研单位。

　　 目前实验室由宋任涛教授担任主任，许政暟教授担任学术委员会主任。实验室设有学术委员会、管理人员队伍和一支约30人的研究人员队伍。主体实验室位于上海大学新校区东区生命大楼内，面积约3000平方米，实验室拥有设备价值1000多万元，具备植物分子遗传、植物基因组学、植物基因工程、能源微生物等研究平台。建有300平方米的可控玻璃温室，并在上海崇明、河南省、海南省等建有能源作物育种和示范基地。