食品中心下设综合业务办公室、理化实验室、微生物实验室、动物与毒理实验室、植物粮谷实验室和转基因与畜产品实验室。主要承担进出口食品、动植物及其产品检验检疫工作。本中心作为国家出入境检验检疫局的重点技术中心，坚持质量第一，严格遵守公正性、科学性、权威性，以第三方公正地位提供准确、可靠、及时的检验报告。