2006年初，为了发挥理论研究方面的传统优势，厦门大学物理系在整合天体物理、统计物理、凝聚态理论与计算模拟、非线性复杂系统等方向的研究力量的基础 上，成立了厦门大学理论物理与天体物理研究所，并成立了以中国科学院理论物理研究所所长欧阳钟灿院士为主席的学术指导委员会。

        研究所现任所长是卢炬甫教授，副所长是帅建伟教授。现有成员30人，其中教授15人、副教授8人、助理教授7人，博士后2人。其中1人获得中国青年科学家奖，4人获国家杰出青年科学基金资助，3人获教育部新（跨）世纪人才基金资助。

        研究所成员承担着国家973计划、国家杰出青年科学基金、国家自然科学基金等各类科研项目，三年来科研经费累计达600多万。近5年来，研究所成员在国际一流杂志 Physical Review Letter、Astrophysical Journal Letters 等重要学术刊物上正式发表SCI论文300多篇，并获得教育部提名国家科学技术奖自然科学一等奖、二等奖等多项奖励。

        研究所依托厦门大学物理学一级学科博士点、理论物理学二级学科博士点、物理学一级学科博士后流动站培养博士研究生和博士后研究人员。