复旦大学微纳光子结构教育部重点实验室于2009年11月通过教育部验收，正式开放运行。

实验室在微纳光子结构领域汇聚复旦大学优秀学科研究力量，逐渐形成了有我国特色并在国际上有着一定影响的研究方向。