南昌大学环境科学与工程实验中心的建设和发展也为学科建设和科研基地建设提供了重要的实验平台和条件。以实验中心为基础和重要组成部分，2004年获批江西省“鄱阳湖综合 治理与资源开发”重点实验室，2007年11月“鄱阳湖湖泊生态与生物资源利用”教育部重点实验室(南昌大学)通过教育部专家正式验收。

　　目前，实验中心与省部重点实验室相辅相成、互为依托、资源共享，中心为重点实验室提供基础训练及工程实践平台，而重点实验室的建设和发展又为实验中心提供了一个更广阔的发展空间。