生物反应器工程国家重点实验室于1989年批准立项，1996年对外开放，在2001年和2006年两次通过国家评估并取得良好成绩。实验室依托于华东理工大学，主要从事生物反应器为核心的生物工程基础和应用基础研究，研究内容涉及生物反应器与过程工程、生物催化与反应工程、生物分子设计与产品工程、生物传感与系统工程、生物炼制与能源生物技术、细胞与组织工程等方面。

　　实验室所依托的华东理工大学生物工程学科的前身是1954年国内率先建立的抗生素制造工学专业，1980年改为全国首个生化工程专业，1982年和 1990年分别建立了国内第一家生物化学工程研究所和第一个生物化工博士点;在国内同类学科中显现出整体优势，研究生生物化工专业实力全国排名第一，生物化工二级学科排名全国第一或第二，化学工程与技术一级学科位列全国前三名。