中心从建所初期的土壤农化研究室演变至今，经历了5个发展阶段，即化验室—烟草化学研究室—中心分析室、化学成分室—分析检测中心—农业部烟草质检中心。 承担的任务也由单纯的化验分析到化验分析与科研共同发展的阶段。中心于2002年通过国家计量认证和农业部机构审查认可双认证，2007年通过“双认证” 复核审查。认证项目包括烟草及烟草制品、土壤、肥料、水质、水果蔬菜五大类共147项参数。