1、TOF和FT-ICR都可以做高分辨，质量分辨率在5ppm或者更低
2、具体应用领域二者都主要是对化合物做定性，TOF可以解决大分子蛋白，分子量在20万以上；FT-ICR相对分子量范围会偏小一点，当然也不是说20万以上的就不可以做。目前两者在蛋白组学上都有应用，这是大分子方面。在小分子方面二者也都有应用比如代谢组学，石化方面复杂化合物分析（石化方面用FT-ICR的似乎更多），中药成分分析，烟草组分分析等。总之二者都是比较适合复杂体系下的多组分定性分析。
3、二者均可以和液相联用，也都可以接MALDI，直接进样也同样都可以。
4、原理上二者是有区别的，简单说：TOF是利用飞行管，使在静电场中的离子瞬间获得动能，在真空中飞行一段时间，根据其获得动能与飞行的时间、距离之间的关系，即E=1/2（mv）2，就可以获得其质量电荷比；而FT-ICR则是使离子进入电磁场，在电磁场的作用下做圆周运动，根据其运动周期输出的正弦波做傅立叶变换，得到质荷比的信息。
5、从价格上看TOF还是要便宜一些，大概在30-45万美元，好的TOF，垃圾TOF就不算了。现在TOF的联用技术也很多，可以是TOF-TOF,Q-TOF,TRAP-TOF，厂家有waters，ABI等。而FT-ICR就更贵一些了，起价基本在50万以上，也可以联用，目前主要是与离子阱联用，赛默飞世尔菲尼根的产品，听说瓦里安出了四级杆接FT-ICR，不过没见过。联用的FT-ICR价格应该在90万美元左右往上。
6、使用上看，所有的带精确质量数的质谱，想要出好的结果，就不用想可以操作简单了，都需要质谱经验比较熟练的技术人员，使用过程中需要不断的频繁校正质量轴，才会得到好的结果。
7、能耗上看，TOF会节省一点，不过买得起这个级别仪器的单位，也不会很在意这两者在能耗上的区别。
8、相对FT-ICR，TOF的更适合高通量分析。
以上有表述不清或者错误的地方还请指正。
挑刺来了
1. ppm是质量精度，不是分辨率，虽然两者有联系 2. 常规TOF测蛋白质的分子量，分辨率那个低哦
3. TOF-TOF现在只有ABI和Bruker有了，Q-TOF有的很多，ABI,Waters,Agilent,岛津有QIT-TOF 4. 常规TOF基本上没有消耗，Q-TOF消耗蛮大的，但ICR的消耗，每年10万RMB以上吧
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