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针对儿童期癌症,赛默飞推出NGS检测产品

2018.4.24
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致力于为分析测试行业奉献终身

  每年,全球有30多万名儿童被诊断出患有癌症。每隔3分钟,世界上某个地方的家庭就会因这份诊断书而心碎。尽管许多儿童期癌症的存活率有所改善,但对于许多儿童来说,癌症仍会大大缩短他们的生命。


  为了解决这个全球性问题,赛默飞世尔科技今天宣布它已建立了国际儿童肿瘤学网络(ICON),并同时推出Oncomine Childhood Cancer Research Assay。这是与洛杉矶儿童医院合作开发的新一代测序panel,专门靶向与儿童和青少年癌症相关的突变。

  据介绍,国际儿童肿瘤学网络是覆盖科研和临床研究人员的全球社区资源,他们通过共享数据,最佳实践和实验方案进行合作,以促进对小儿、儿童和青少年癌症的深入了解。研究人员可以注册成为ICON的会员,并访问由网络会员上传到ICON数据库的数据集。

  过去对儿童期癌症的研究大大落后于成人癌症的研究,不过,最近的一些研究行动已鉴定出大量反复发生的体细胞变异,揭示出其与成人癌症的根本差异。成人癌症大多是由随时间积累的突变引起的,而儿童期癌症往往起源于胚胎或神经外胚层,主要由基因融合驱动。

  为了对这些肿瘤样本进行全面分析,新上市的Oncomine Childhood Cancer Research Assay将特定突变、基因扩增和基因融合放在一个panel里。这项检测由科学家和儿科肿瘤医生共同设计,利用无缝的NGS流程拷问DNA和RNA中的多个基因和1,700个融合转录本。

  洛杉矶儿童医院个性化医疗中心的主任Timothy J. Triche博士表示:“Oncomine Childhood Cancer Research Assay具有特别重要的意义,因为它是首次针对所有形式的儿童期癌症设计的,能同时检测RNA基因融合和DNA突变,这两者都至关重要。”

  赛默飞提供了完整的测序和分析流程。Oncomine Childhood Cancer Research Assay可与Ion Chef系统整合,实现自动化的文库制备和扩增,之后,可在全新的Ion GeneStudio S5系统上开展测序,并利用Ion Reporter软件进行下游的数据分析和报告。

  加拿大BC省儿童医院的Chris Maxwell博士已经试用了该产品。他认为:“驱动儿童期癌症的遗传变异与成人的完全不同,但奇怪的是市场上并没有相关的工具,来帮助研究人员全面分析样本。”

  Maxwell博士所率领的团队利用Oncomine Childhood Cancer Research Assay来分析长期保存的FFPE肿瘤组织,发现该检测不仅简单易用,还能快速可靠的结果。“这让我们能够快速检测靶向药物与肿瘤细胞的关系。这种新检测填补了空白,加速了我们实验室的研究,”他说。

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