三分类血细胞分析仪的基本原理是电阻抗（库尔特原理）原理，即血细胞作为一种物理颗粒，在通过电场时产生电阻，从而出现脉冲波，脉冲波的数量反映了血细胞的数目；而不同体积大小的血细胞所产生的脉冲波大小也不相同，根据脉冲波的大小可以对不同的血细胞进行分类计数。
全血进入血球分析仪以后，白细胞进入白细胞计数通道，仪器计算机部分可将白细胞体积从35－450fl分为256个通道，每个通为1.64fl；而红细胞和血小板进入另一个共用通道，其中血小板储存于64个通道，体积范围为2－20fl。
仪器在白细胞通道中按体积大小，将白细胞分成三组：35－98fl的为淋巴细胞，98－150fl的为中间细胞（其中包括单核细胞，嗜酸和嗜碱性粒细胞）和150－350fl的嗜中性粒细胞。
仪器在红细胞和血小板通道中也按体积大小区别红细胞和血小板：3－30fl的被认定为血小板，而30fl以上的被认定为红细胞。
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