RT-PCR 与WB结果的变化趋势并不总是一致的,可以从以下几个方面来解释：
1、基因的表达分为转录和翻译两个层面，即mRNA水平和蛋白水平。而真核基因表达的转录和翻译发生的时间和位点存在时空间隔；
2、在转录后，又会有转录后加工，转录产物的降解，翻译，翻译后加工及修饰好几个层面。所以转录水平和翻译水平并不完全一致，且这种调节在不同蛋白质之间存在差异；
3、mRNA与蛋白质的半衰期不同，mRNA极易降解，在组织内存在时间较短，而翻译成蛋白质后性质较稳定；
4、正常状态下，细胞内可能存在一定量的蛋白质储备，不行使功能，而这种储备量的多少在不同组织有所不同；
5、与检测方法有关，RT-PCR检测mRNA的灵敏度非常高，理论上只要有一个拷贝的目的基因即可检测；
6、蛋白质是行使功能的基本单位，所以归根结底要落实到蛋白水平究竟怎么变化，从而判断其对相应功能的影响。
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