一．即取即用：由于超纯水被取出后很容易遭到环境的污染，所以使用前才取水的“即取即用”方式zui为适当。此外，将超纯水系统与有机溶剂使用场所加以隔离，或是在化学通风柜、无菌操作台进行取水，也能降低污染。若无法做到前述要求，定期对实验室进行换气通风也会有一定的效果。
二．改善取水环境；
三．使用低溶出的容器：实验表明，在做HPLC实验时，用玻璃器皿作为取水容器较为适合，而用离子色谱分析法分析离子含量时，聚丙烯（PP）容器更为适合；进行微量元素分析时，尽量不要使用金属元素的溶出的容器，特富龙或聚乙烯容器较为适合。但是，不同的厂商生产的相同材质的容器，其使用效果也是不同的，在使用前必须以实验来确认。
四．充分洗净容器，妥善保管：所谓的洗净，并不只是在使用前将污垢去除，而是直到实验使用前为止，都应该避免与那些会影响检测结果的污染物质借出。特别是进行微量元素分析时，由于空气中的悬浮颗粒（富含碱金属和碱土金属）会造成容器污染，进而对检测的结果产生显著影响，所以洗净后的容器必须先盛满超纯水，或是盛满未经沸腾蒸馏处理过的硝酸溶液。此外，必须有专用于高纯度待测样品的容器，不可作为其它用途，以避免交叉污染。
五．容器的分类使用：试验中，应将不同实验用途的容器分开使用，避免混用，以防止交叉污染。
六．排掉初期产水：排水初期所取得的水质有明显的水质劣化现象，主要是终端滤膜所造成的超纯水滞留。HPLC分析实验表明：排水1L后的水质，具有较稳定的背景值。也就是说，超纯水取水时一定要将初期产水放掉，以获得稳定的水质。
七．加强取水口的管理：取水口切不可接软管之类的物品。较长时期不用，建议用无菌手套套住终端过滤下端的套筒。
八．在不起气泡的情况下取水：从超纯水系统取水时，应避免使水从高处落下产生许多气泡，因为这会加速空气中污染物质的混入。我们建议在取水时候让超纯水顺着洁净容器侧壁流入，使得气泡不易产生，可降低空气的污染。
九．放入洗瓶中的超纯水的合理更换：在配置高纯度的化学试剂时，尽量不要使用洗瓶中的水（一般放置半小时，水质会下降一半）；若一定要使用洗瓶，请在使用前更换成新鲜的超纯水。
十．在取水时，认真确认水质监测仪：超纯水的水质标准十分严格，稍有下降，必有原因。在使用超纯水时候，应该认真确认水质检测仪器所示水质参数，如从18.2兆欧降低到18.1兆欧，不可以忽视，详细分析原因后才可使用。
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