实验材料 | |
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试剂、试剂盒 | |
仪器、耗材 | |
实验步骤 | 方法 1: 酶催化的蛋白质片段化1.固定聚丙烯酰胺凝胶中分离的蛋白质,用考马斯亮蓝染色(5~lOmin),然后脱色。 如果蛋白质条带太浅,重复染色和脱色的步骤,或延长染色时间。 2.将凝胶放入透明的盒子中,用手术刀切下蛋白质条带,把条带分别放入聚丙烯试管中。 3.用 10 ml 含有 1 mol/L Tris-Cl 的乙醇,浸泡切下来的含有对照蛋白点的凝胶条带,室温 30 min,使凝胶收缩。 这一步有助于切下来的胶进入第二块平板胶。如果肽谱作图时着色太浅,应缩短浸泡时间。 4.将凝胶带切成碎片,把它们放到第二块平板胶的不同的上样孔中,第二块凝胶应是长的(5 cm) 浓缩胶。用干净的匙引导碎片落到孔的底部。 5.在碎片胶的周围,用注射器注射蛋白酶消化缓冲液。 6.在每个样品上方覆盖 10ul 的蛋白酶溶液。 用足够的蛋白酶以完成消化。最初试着用酶:底物为 1:50 的比例。 7.电泳,直到溴酚蓝到达浓缩胶的底部。 8.关掉电源 20~30 min,使蛋白酶消化蛋白样品。 9.继续电泳,直到溴酚荜到达平板胶的底部。 10.用考马斯亮蓝染色或银染(见方案 9 或方案 11),使蛋白质显色;或用放射自显影术或荧光摄影术检测放射性标记的蛋白质。 方法 2: 化学方法使蛋白质片段化1.固定凝胶,考马斯亮蓝染色(5~10min),然后脱色。 如果蛋白条带太浅,重复染色和脱色的步骤,或延长染色时间。 2.将凝胶放人透明的盒子中,用手术刀切下蛋白质条带,把条带分别放人 1.5 ml 聚丙烯试管中。 3.用 SpeedVac 浓缩器(或其他设备,如吹风机)使切下来的凝胶干燥。 4.加入约 10ul 化学断裂试剂(1mg/ml),直接倒在干燥的凝胶片上,再加入 90W 断裂试剂。 5.将混合物孵育一定的时间(关于孵育条件,见方案 6、方案 7 或方案 8)。 6.仔细吸出含有肽段的上清液。 7.用 SpeedVac 干燥样品,加入 50ul 水,再次干燥样品。 8.重复水洗和干燥过程,2 次。 9.加入 10~30ul SDS-PAGE 上样缓冲液,煮沸样品 5 min。 10.把上述样品加到 SDS-PAGE 凝胶中,电泳,直到溴酚蓝到达平板胶的底部。 11.用考马斯亮蓝染色或银染(见方案 9 或方案 11),使蛋白质显现。或者,用放射自显影术或荧光摄影术检测放射性标记的蛋白质。 展开 |