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酵母遗传学方法3:RNA的分离

2019.4.30
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zhaochenxu

致力于为分析测试行业奉献终身

酵母RNA的分离

1)总酵母RNA的分离

1.在每毫升培养物中加入50μg环乙酰亚胺,在30℃下振荡15分钟。此步亦可省略,但是有人认为环乙酰亚胺可防止mRNA凝集在多核糖体上。

2.迅速冷冻收集细胞,在大离心管中加入约一半体积的碎冰,将培养物倒入,振荡,在4℃下以5000r/min离心5分钟。

3.加入11g玻珠于30ml离心管中,以Corex玻璃离心管为最佳,不过塑料离心管也能使用。

4.加入3ml已用LETS缓冲液平衡的苯酚到玻珠中。

LETS缓冲液:

0.1 mol/L 氯化锂

0.01  mol/L Na2EDTA

0.01  mol/L Tris-HCl (pH7.4)

0.2% SDS

0.1% 二乙基焦碳酸(可任选)

5.2.5ml冰预冷的LETS缓冲液悬浮细胞,并将其加入到上述玻珠苯酚管中。为了使细胞破碎的最好,液面应刚好高于玻珠表面。

6.高速振荡30秒后,在冰上置30秒,交替进行3分钟,用相差显微镜检测细胞破碎情况,破碎的细胞呈现无折射的空细胞。

7.当至少90%细胞破碎后,用5ml冰预冷的LETS缓冲液,轻微振荡,用Sorvall SS34转头以8000r/min离心5分钟,使溶液分相。离心后,酚层和蛋白质界面应刚好低于玻珠表面,移出水相而不会触动界面。

8.将水相转到一个干净离心管,用5ml苯酚:氯仿:已戊醇(25241)抽提2次,避免触动界面。用氯仿抽提一次。

9.加入1/10体积的5mol/L氯化锂,在-20℃下沉淀3小时。此时,RNA沉淀可在-20℃下存放。

 

2Poly(A)+RNA的分离

1.将保存的RNASorvall SS-34转头以10 000r/min离心10分钟,收集RNA沉淀,用80%乙醇洗涤。真空干燥后,溶于2.5ml蒸馏水中,溶解后加入2.5ml 2×上样缓冲液,同时加SDS至终浓度为0.3%。

2.65℃保温5分钟。

3.装一个oligodT)柱,用1×上样缓冲液洗3次。

4.10mmol/L HEPESpH7)洗脱PolyARNA。如果希望得到更满意的结果,可用加入RNase抑制剂。

5.用蒸馏水对PolyARNA进行10倍稀释,通过OD260的光吸收测定RNA浓度。用水将10mmol/L HEPES(pH7)稀释10倍作为对照。

6.1/10体积3mol/L醋酸钠和2.5倍体积的无水乙醇沉淀RNA,上下倒置混匀,在-70℃下放置30分钟。离心10分钟,弃上清液,用水溶解RNA沉淀使终浓度为1mg/ml。不管是溶解的RNA或是乙醇沉淀的RNA都能在-70℃下长期保存。


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