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TRIZOL提取注意事项-2

2019.8.02
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zhaochenxu

致力于为分析测试行业奉献终身

实验所需但试剂未提供的物品:

* 氯仿 *异丙醇

* 75%乙醇(用DEPC处理过的水配制)

*无RNA酶的水或0.5% SDS溶液[配无RNA酶的水,将水加入无RNA酶的玻璃瓶中,加入DEPC至0.01% (v/v)。放置过夜并高压灭菌。SDS溶液必须用DEPC处理过并经高压灭菌的水配制。]

1.匀浆化作用(见注意事项1-3)

a. 组织 用glass-Teflon蚯苛υ冉(Polytron, 或 Tekmar's TISSUMIZER 或equivalent)搅匀组织样品,每50—100 mg组织加1ml的TRIZOL。匀浆化时组织样品容积不能超过TRIZOL容积的10%。

b.单层生长的细胞 直接往直径3.5 cm的培养板中加入1ml的TRIZOL溶解细胞,通过移液管分次移出细胞裂解物。依据培养板的面积而不是依据细胞的数量来决定所需的TRIZOL量(每10 cm2加1 ml)。当TRIZOL量不足时可导致抽提的RNA中污染有DNA。

c.悬浮生长的细胞通过离心来沉淀细胞。在TRIZOL试剂中用移液管反复吹打来裂解细胞。每5—10×106的动物细胞,植物或酵母菌细胞或每1×107 细菌加1ml的TRIZOL。在加入TRIZOL前应避免洗涤细胞因为那样会增加mRNA降解的可能性。破裂某些酵母菌和细菌可能需要使用匀浆器。

可选方案:

当样品富含蛋白质,脂肪,多糖或是细胞外物质例如肌肉,脂肪组织和植物的块茎部分时可能需要一额外的分离步骤。匀浆化后在2—8°C的条件下以12,000×g的离心力离心10分钟,移除匀浆中不溶解的物质,余下的沉淀中包含有细胞外膜,多糖,以及高分子量DNA,而上层的超浮游物含有RNA。在来自于脂肪组织的样品中,大量的脂肪漂在最上层因而应该除掉。在每一个个案中,将清亮的匀浆溶液转移到一干净的试管中加入氯仿并继续进行下述的分离步骤。

2. 分离阶段将匀浆样品在15—30°C条件下孵育5分钟以使核蛋白体完全分解。每1 ml TRIZOL加0.2 ml氯仿。盖紧样品管盖,用手用力摇晃试管15秒并将其在30°C下孵育2—3分钟。在2—8°C下以不超过12,000×g的离心力高速冷冻离心15分钟。离心后混合物分成三层:下层红色的苯酚-氯仿层,中间层,上层无色的水样层。RNA无一例外地存在于水样层当中。水样层的容量大约为所加TRIZOL容量的60%。

3. RNA的沉淀将水样层转移到一干净的试管中,如果希望分离DNA和蛋白,有机层同样要予以保留。通过将水样层和异丙醇混合来沉淀RNA。最初均化时的每1 ml TRIZOL对应0.5 ml异丙醇。将混合的样品在15—30°C条件下孵育10分钟并在2—8°C下以不超过12,000×g的离心力高速冷冻离心10分钟。RNA沉淀在离心前通常不可见,形成一胶状片状沉淀附着于试管壁和管底。

4 .RNA的洗脱 移去上层悬液。用75%的乙醇洗涤RNA沉淀一次,每1 ml的 TRIZOL至少加1 ml的75%乙醇。旋涡振荡混合样品并在2—8°C下以不超过7,500×g的离心力高速冷冻离心5分钟。

5. RNA的再溶解在操作的最后,简单干燥RNA沉淀(空气干燥或真空干燥5—10分钟)不要在真空管里离心干燥RNA。尤为重要的是,不能让RNA沉淀完全干燥那样会极大地降低它的可溶性。部分溶解的RNA样品其A260/280比值< 1.6。用移液管尖分几次移取无RNA酶的水或0.5% SDS溶液来溶解RNA,并在55—60°C下孵育10分钟(当RNA以后要用于酶切反应时,避免使用SDS。)RNA还能被100%甲酰胺(除去离子)再溶解并保存在–70°C。

RNA抽提注意事项:

1.从少量的组织(1—10 mg)或细胞(102—104)中分离RNA 样品:往组织或细胞中加入800 祃 TRIZOL。待样品裂解后,加入氯仿并进行步骤2中的抽提操作。在用异丙醇沉淀RNA之前,加入5—10μg无RNA酶的脂质体(Cat.No 10814)作为水样层的载体。为降低其黏度在加入氯仿前用26号注射器抽吸两次以切断基因组DNA。脂质体会留在水样层中并和RNA共析出。在浓缩到4 mg/ml之前它不会抑制第一丝状体的合成也不会抑制PCR。

2.在匀化后和加入氯仿之前,样品可以在–60—–70°C保存至少一个月。RNA沉淀(步骤4,RNA洗脱)溶于75%的乙醇在2—8°C至少可以保存一周,在–5—–20°C下至少可保存一年。


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