如前文所述，为通过二氧化碳培养箱，真实还原微生物在人体内的繁育、生长情况。除具备37℃这一种必要条件外，CO2在箱体内的浓度也十分必要。为保证获得良好的实验效果，操作人员也必须学会如何控制二氧化碳培养箱中的CO2浓度。
CO2浓度控制：
(1)温度达到设置温度4小时后，工作室内湿度达到饱和，这时才可以进行CO2浓度控制的操作。
(2)按下CO2控制开关(CO2 Gas 19)两秒钟后，CO2浓度显示窗(% CO2 21)会显示工作室内当前的CO2浓度，如不为零则要进行“置零”操作。
(3)CO2浓度设置：操作CO2浓度设置模式选择键(mode 13),能使CO2浓度控制系统分别进入CO2浓度设置模式、零点设置模式、CO2浓度校正设置模式、CO2浓度检测控制模式。
a、CO2浓度设置：按下CO2设置模式选择键(Mode
13)两秒钟后松开，CO2浓度设置指示灯(Set 4)亮，CO2浓度显示窗(% CO2
21)数值闪烁，表示进入CO2浓度设置状况，按CO2增加键(∆ 14)或CO2减少键( 15)进行调整，同时输入设置数。
b、置零方法：再按下CO2设置模式选择键(Mode 13)，CO2浓度置零指示灯(Zero 5)亮，然后同时按下CO2增加键(∆ 14)和CO2减少键( 15)4秒钟，即可自动置零。同时自动返回到CO2浓度检测控制模式，进入工作状况。
c、CO2浓度校正：在不进行置零操作的情况下，再次按CO2设置模式选择键(Mode
13)后，使CO2浓度校正指示灯(Adjust 6)亮，仪器可进入CO2浓度校正状况。按CO2增加键(∆ 14)或CO2减少键(
15)进行调整，输入校正值。注意：校正只能依据更高精度仪器的检测，校正须在仪器稳定状况下进行(校正前1小时不允许打开玻璃门)。
d、再次按CO2设置模式选择键(Mode 13)后，则返回到CO2浓度检测控制模式，进入工作状况。
(4)当以上置零和设置操作完成以后，才可以打开CO2钢瓶上的减压器，调整压力在0.1 MPa ~ 0.12 MPa左右，使CO2气体进入工作室。
(5)CO2进气指示灯(CO2 On 3)亮，表示电磁阀通电打开，工作室进气；工作室CO2浓度接近设置数时，进气会间断进行，以保证控制准确。
(6)如果电磁阀通电打开超过30分钟会自动关闭，进入断电保护状态，即使CO2浓度没有达到置定数，CO2进气指示灯(CO2 On 3)也会自动熄灭。这时超时显示灯(Overtime 2)亮，须检查气源情况，更换气源，恢复气压后按CO2
设置模式选择键(Mode 13)，使CO2进气指示灯(CO2 On 3)亮，仪器恢复正常运行。
(7)CO2浓度过高指示灯(CO2 High 1)亮，表示浓度超过设置值1.0%，应检查电磁阀是否密封。
(8) 校零：仪器每工作6个月，应进行一次零位校正，操作过程如下：
a、关闭气源。
b、打开玻璃门5分钟，放空工作室CO2气体，使加湿盘内装有灭菌水。
c、关闭玻璃门升温并恒定2小时，使温度稳定、湿度达到饱和。
d、按上述置零方法(第五.2.(3). b条)操作。
(9)按下CO2控制选择键(Mode 13)两秒钟后，无论进入何种设置状态，若8秒钟内不进行任何操作，仪器即自动恢复运行状态。
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