多抗和单抗优缺点比较
多克隆抗体能识别任一抗原上的多个表位，而单克隆抗体仅检测任一抗原上的一个表位。但是它们两者有着属于各自的优点和缺点。
多克隆抗体的优点
多克隆抗体可有助于放大低表达水平的靶蛋白信号，因为靶蛋白可在多个表位上结合不 止一个抗体分子。但是这会给定量实验造成不利影响，因为结果将变得不准确。
由于能识别多个表位，多克隆抗体可在 IP/ChIP 中得到更好的结果。
比单克隆抗体更能容许抗原中的微小变化。
它们会识别出与免疫原蛋白质具有高同源性的蛋白质，或者从非免疫原物种的组织样品中筛选靶蛋白，例如当未测试物种中的抗原性质未知时，有时会使用多克隆抗体。这也 使得检测免疫原序列以确定是否有任何交叉反应性非常重要。
多克隆抗体通常是检测变性蛋白质的首选。
多表位通常可提供更为有力的检测。
多克隆抗体不适用于探测抗原的特定结构域，因为抗血清通常可识别多个结构域。
不足之处
易于产生批次间差异。
产生大量非特异性抗体，有时可能在某些应用中产生背景信号。
多表位使得检测免疫原序列以确定是否有任何交叉反应性非常重要。
客观事实
识别任一抗原上的多个表位。获得的血清将包含不同亲和力抗体的异质复合体混合物。多克隆抗体主要由 IgG 亚类组成。
肽免疫原通常用于产生靶向唯一表位的多克隆抗体，特别适合高同源性的蛋白家族。
抗体制备
制备所需技术和技能不高。
制备时间短。
多克隆抗体不适用于探测抗原的特定结构域，因为多克隆抗血清通常可识别多个结构域。
单克隆抗体的优点
杂交瘤制得后，就成为了恒定的再生源，所有批次都将相同–对确保实验步骤和结果的 一致性和标准化非常有帮助。
单克隆抗体通常在切片和细胞染色造成的背景较低。因为它们以更强特异性检测一个靶 表位，所以不太可能与其它蛋白质发生交叉反应。
由于具有特异性，单克隆抗体非常适于用作分析测定中的一抗，或者用于检测组织中的 抗原，并且通常所产生的背景染色显著低于多克隆抗体。
与多克隆抗体相比，单克隆抗体的同质性非常高。如果实验条件保持不变，单克隆抗体 的各实验结果重现性很高。
单克隆抗体的特异性能使其在混合物中和抗原高效地结合。
不足之处
可产生大量特异性抗体，但是可能特异性过强。
经过抗原的化学处理后比多克隆抗体更易于丢失表位。这可通过使用同一抗原的两个或多个单克隆抗体进行补偿。
客观事实
仅检测抗原上的一个表位。
它们仅由一个抗体亚型组成。在需要二抗进行检测时，应针对正确的亚类选择抗体。
抗体制备
需要高技术。
需要先培训才能使用技术。
制备杂交瘤耗时长。
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