由于环境及生活方式的改变，不孕不育患者在人群中的比例大幅升高，不孕不育症将成为继肿瘤和心血管疾病之后的第三大疾病。
目前，全世界约10%-15%的夫妇罹患不育症，其中，男性不育因素占50%[1]，引起男性不育的原因有很多，因遗传缺陷导致的不育约占男性不育的30%[2]。
导致男性遗传学异常的原因主要有Y染色体微缺失、染色体结构和数目异常、基因突变等。在精子发生障碍引起的男性不育患者中，Y 染色体微缺失的发生率仅次于Klinefelter综合征（克氏综合征），是居于第二位的遗传因素。
过去十年中，科学家们研究了世界范围内的男性不育患者微缺失的发生情况，近几年也完全阐明了Y染色体微缺失与导致不育的精子发生障碍之间的关系。欧洲男科学协会/欧洲分子遗传实验质控作网(EAA/EMQN)联合出版的Y
染色体微缺失分子诊断操作指南中，已经将Y 染色体微缺失作为无精子症和寡精子症不育患者的常规检查项目。
1999年，EAA/EMQN为提高诊断质量，联合出版了Y 染色体微缺失分子诊断指南，并提供了客观的质量评价实验方法，制定了Y染色体微缺失基因检测的指导原则，这一指导原则灵敏，准确且易于操作。
到了2004年，EAA/EMQN总结了5年间最新的Y染色体相关临床资料（经典方法、部分基因特异性缺失、基因型-表型相关性、方法学论证），根据2003 年10 月在佛罗伦萨举行的“Best Practice Meeting”的成果，在1999年制定的指南基础上出版了2004版Y染色体微缺失实验操作指南，并更新了结果质量控制措施。
04版指南确认了1999年版本的准确性，并推荐在每个AZF区域使用2个STS：sY84(AZFa)、sY86(AZFa)、sYl27(AZFb)、sY134(AZFb)、sY254(AZFc)，sY255(AZFc)，指出采用这些引物几乎能够检测到所有临床上的相关缺失和文献报道的三个AZF 区域95%以上的缺失。
经过10年的研究积累，到2013年EAA/EMQN重新修订了指南，证实了gr/gr缺失是损害精子生成的一个重要因素。
最新版的指南再次确认基于双重PCR的检测方法对于Y染色体微缺失常规筛查诊断仍然是有效的，04版推荐的6个STS位点仍然可以完全满足常规检测，推荐所有实验室都采用这6个位点。
并指出目前一些最新的检测方法和工具（检测更多STS位点），并不能增加检测的灵明度，反而可能使结果复杂化、难以解释，因此最新版指南并不推荐。同时13版指南强烈建议实验室每年参加外部质量评估计划。
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