毛细管电泳色谱仪毛细管内壁改性主要是为消除吸附和控制电渗流，通常采用动态修饰法和表面涂层法。
一、毛细管内壁动态修饰：
动态修饰是在运行缓冲液中加入添加剂，如阳离子表面活性剂十四烷基三甲基溴化铵，在管内壁形成物理吸附层，使电渗流反向。添加剂还有聚胺、聚乙烯亚胺（PEI）和甲基纤维素等。
二、毛细管内壁表面涂层：
涂层方法有物理涂布法和化学涂层法。最常用的方法是采用双官能团的偶联剂，如各种有机硅烷，*个官能团（如甲氧基）与管内壁上的游离羟基进行反应，使其与管内壁进行共价结合，再用第二个官能团（如乙烯基）与涂渍物（如聚丙烯酰胺）进行反应，形成稳定的涂层。此外，还有纤维素、聚乙烯亚胺和聚醚组成的多层涂层、亲水性的绒毛涂层和联锁聚醚涂层等。
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