越来越多的科学证据提示，此次新型冠状病毒起源于蝙蝠，这些科学证据包括，中国科学院武汉病毒研究所石正丽团队1月23日发表在学术平台bioRxiv预印版上的文章。石正丽团队发现，新型冠状病毒与一种蝙蝠携带的冠状病毒序列一致性高达96%。此前，还有科学研究发现，蝙蝠还是埃博拉、SARS、马尔堡等病毒的自然宿主。
中国医学科学院病原生物学研究所所长金奇教授表示，蝙蝠携带的病毒正常条件下不能直接感染人类，可能通过“中间宿主”感染人类。现在问题是，“中间宿主”到底是谁？有科研论文和社会上的流行说法将“犯罪嫌疑人”指向蛇、豺等动物，都需要进一步去确证。
金奇说，实际上，“中间宿主”的确定需要严谨、公认的科学流程：在“中间宿主”中分离到可在其体内繁殖复制的病毒；分离出的病毒能够在动物模型上显示致病性及病理特征等；还要确认该病毒在感染传播链中的位置，比如是通过携带病毒的动物感染人，还是已经感染病毒的人再感染动物等。总之，不能轻易得出结论，应鼓励继续通过各种科学手段开展新型冠状病毒溯源研究。
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