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在热流型DSC的设计上，内藏均热块。在样品、参比物和均热块之间设置热阻，通过检测热阻的温度差而得到样品和参比物的温度差。样品和参比物所产生的热量通过热阻与均热块进行热交换，通过检测样品均热块和参比物均热块之间的热流差所导致的温度差，通过换算以DSC信号输出。
由于结构的不同，一般认为，功率补偿型DSC由于没有均热块而只是使用微型加热器对样品和参比物加热，适合于对快速升降温要求的DSC测定。热流型DSC由于有内藏的均热块，样品和参比物完全被温度控制，所以基线的稳定性好。
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