Orbitrap Exploris™ 480的鉴定性能、软件特性和蛋白质组学应用1

在这期中我们一起来领略一下Exploris 480的强悍性能，以及新的软件特性如何将蛋白质组学推向一个新的高度。

1.Orbitrap Exploris™ 480的鉴定性能

Exploris 480是在Q Exactive HF-X的基础上改进而来，因此其绝对性能指标也是达到了新的高度。其最高扫描速度为40Hz，与Q Exactive HF-X一致。相比Q Exactive HF-X，Exploris 480有着更高的分辨率和灵敏度，更宽的质量范围和更为丰富的定量模式和选装模块。

性能指标

性能：强悍的性能指标带来的是不断突破记录的鉴定能力

上样500ng – 1μg Hela全细胞酶解产物，单针60分钟的梯度可实现超过5,000个蛋白的鉴定（图1）。

图1. 60分钟梯度Exploris 480的蛋白鉴定数量

非标定量

在Hela细胞样品中掺入酵母样品来考察非标记定量的准确性亦得到了非常优良的结果，由于动态范围和谱图质量的提升，在非标记定量的实验中“Match Between Runs”组件的效果得到了更加明显的体现（图2）。

图2. Orbitrap Exploris™ 480进行非标记定量的性能评估

2.兼容全新一代FAIMS Pro，进一步提升定性定量能力

在2018年9月份的HUPO上，赛默飞推出了全新一代的FAIMS Pro (High-Field Asymmetric Waveform Ion Mobility Spectrometry, 高场非对称波形离子迁移谱)，该接口可搭载于TNG系列的质谱仪，例如Orbitrap Fusion, Orbitrap Fusion Lumos质谱仪。搭载该接口可显著提升质谱的定性定量能力，一经面世即受到市场的热捧。

Orbitrap Exploris™ 480也采用了TNG式样的离子源，因此可以选配FAIMS Pro来进一步提升仪器能力。FAIMS Pro是一种大气压条件下的离子迁移谱，对于肽段样品来说主要通过肽段带电性质的不同来进行分离，从而作为一种在线的气态样品分级手段来提高复杂样品的定性和定量效率（具体内容请见相关阅读）[1, 2]。将FAIMS Pro作为在线分级手段分别用-40CV/-55CV/-65CV进行60分钟采集的话可轻松实现54,000+个unique peptide, 对应6,300+个蛋白的鉴定。