高通量基因分型检测平台及其应用案例

Agripheno™高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液体处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。

Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA，通量达到800个样本/3小时。同时，适用于多种样本类型的DNA提取，包括植物叶片、种子，毛发、血方卡、精液、口拭子、唾液、组织等。提取的DNA适用于多种下游应用，如基因分型、一代测序、二代测序等。

Oktopure DNA提取仪

Nexar高通量吸取样品DNA和引物、mix至384孔卷带并封膜。Soellex对封膜完成的卷带进行PCR水浴热循环，每次最多可达230,000个样本。Araya对水浴完成的卷带扫描分析，28秒扫描一张卷带。

Nexar®模块化内联液体处理与分析系统

Soellex®高通量PCR水浴热循环系统

Araya®内联荧光检测系统

Agripheno™基因分型采用KASP（KompetitiveAllele Specific PCR）原理，对目标SNPs和InDels进行精准的双等位基因分型。反应体系仅1.6μl，具有高通量、低成本，准确率和检出率接近100%的明显优势。

客户需提供

每个位点至少10个阳性对照。 

服务周期

引物测试完成后，每批样品一周内出结果。

应用案例

牛毛基因分型

项目背景：牛奶里的蛋白有两种，酪蛋白和乳清蛋白。酪蛋白中的β酪蛋白分为A1和A2型。人在消化蛋白的时候，消化酶会在A1β酪蛋白67号位置一刀切，产生一种7个氨基酸的肽链（BCM-7），而无法切A2蛋白。BCM-7会导致许多人无法吸收牛奶中的营养成分，通常表现为喝奶后出现不同程度的胀气、腹痛、腹泻等胃肠不适现象。而A2型牛奶更易吸收。A1, A2的区别是由奶牛的基因不同造成的，不同基因的奶牛会生产出含有不同蛋白质类型的牛奶。所以，需要检测奶牛的基因型用于奶牛育种。

项目目的：检测不同奶牛的SNP基因型（决定牛奶A1A2类型的位点）。

实验过程：

分型结果：

每个数据点代表一个独立的DNA样本的荧光信号，相同基因型的样本会发出相似水平的荧光，因此富集在一起。