必要时，可先将cartoo隐藏起来，等调整好label后，再显示出来），让视图更清晰。经过上述一系列操作，得到下图：
2.6. 生成图片
上面的图已经可以发表文章了，但为了更好看，还需要进行一步：光线追踪（Ray tracing）。
继续使用命令：
至此，我们拿到3张图片：focus.png、label.png和overview.png。下面讲述如何使用PS处理这些图片。
3. 使用PS添加字体
打开PS，将focus.png文件拖进界面。此时，图片背景可能有一排排的灰色格子，这是因为PyMOL生成的png图片背景是透明的。只需要将图片设为背景图层（默认背景颜色是白色，如果不是，请自行更改），即可去除格子，得到白色背景的图片。操作如下：
然后，参照label.png文件，为focus图添加文字标签。
按字母T键，然后左键点击图片任意地方，即可输入文字内容，完成后按右侧小键盘的Enter键（并非平时使用的字母键盘Enter键，两者功能在PS中略有差异）或者干脆点击工具栏上的打勾标识（下图右端）。在输入内容之前，还要调整一下字体大小、样式和颜色，比如设为Times New Roman字体，Bold样式和黑色。
并给文字添加白色描边，以便在颜色接近的图片区域中也能清楚辨认。
按住Ctrl+Alt，点击并拖动标签至其他需添加标签的位置，即可复制出一个新的标签，然后修改文字内容即可。依次添完所有标签，并放置合适的位置。对于氢键距离，我们设置的字体大小为18。
将当前状态保存为focus.psd文件（Ctrl+Shift+S）。最后，合并图层（Ctrl+Shift+E），再保存为图片focus.tif文件。由于PyMOL生成的图片规格是2000像素 × 2000像素，300 dpi。我们直接保存即可。若想更改规格，可按Ctrl+Alt+I键，根据提示修改相应的值。
至此，我们便制作成可用于发表文章的高质量结合模式图：
4. 使用PPT制作成品图
为制作一张展示结合口袋在蛋白整体位置、并将口袋内的相互作用细节放大的图片，我们使用PPT将focus.tif和overview.png拼合并加以修饰。
1、 打开PPT，将图片拖进同一界面（注意先把预设的东西清理掉），摆至合适位置；
2、 点击focus图，设置图片大小和边框（见下图）；
3、 添加正方形，覆盖蛋白口袋，大小为6 cm × 6 cm，不填充颜色，边框颜色和样式与focus图一致；
4、 添加两条相同颜色的虚线，连接focus图和正方形。
按Ctrl+A，将全部图片和图形选上，再按Ctrl+G，即合并为一个图。右键单击图片，选择“保存为图片”，保存为combine.tif文件即可。打开图片会发现，有一些区域的背景是透明的，可用PS处理，按上面所述设置背景颜色。最后调整画布和图象大小，保存文件即可。
注意：从PPT保存出来的图片的像素会发生变化（降低），尽管再用PS处理，仍不免质量损失。为从PPT保存成高清图片（300 dpi），需要一番设置。由于操作复杂，在这里不详细展开。感兴趣的朋友可以参考这里的操作：
http://www.360doc.com/content/18/0621/17/7669533_764184334.shtml
最后，让我们好好欣赏这件精美的作品吧。祝大家做优质图片，发高分文章！
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