离子阱中的稳定区域可以通过马绍方程计算出来，化合物离子在特定的射频电压下按照特定频率移动，增加RF 电压， 离子的频率（q 值）将会增加，逐渐提高射频, 使离子从低m/z 到高m/z 逐渐依次离开，完成扫描。
图3. 离子阱扫描原理
Thermo ZL的线性离子阱质谱
作为离子阱质谱的领导者，Thermo ZL的线性离子阱提供最快的速度同时保证优异的灵敏度
● 离子沿着中心线方向聚集，同时也减少了空间电荷效应，极大提高离子容量；
● 双径向检测器设计同时检测离子，离子检测速度更快，响应强度更高，信号更加稳定；
● 离子捕获效率更高，获得更高的灵敏度，进行更多级数的碎裂；
蛋白质组学
● 最大序列覆盖率，源自卓越的循环时间和灵敏度
● 自动MSn 触发数据依赖中性丢失扫描
● 灵活的离子化模式、进样口和色谱解决方案
药物研发定量
● 优异的离子统计学使定量稳定可靠
● 碰撞能量归一化获得最高工作效率
● 为规范实验室提供同时定性和定量数据
法医和临床分析
● 持久稳定性适应复杂基质样品可靠定量
● 正、负离子模式下同时定量和定性
● 简便地操作提高实验室效率
代谢物鉴定
● 出色的MSn 谱图质量和全扫描采集技术
● 低浓度代谢物结构确认，无需了解MRM 信息
● 数据依赖和动态排除技术可以从复杂样品中获得最多信息
数据采集
多种扫描方式
Thermo 离子阱提供丰富的采样模式，既有通用模板帮助快速建立分析方法，又有拓展功能满足深入分析的需要。
注：Zoom 扫描是通过降低扫描速度增加分辨率的一种离子阱扫描方式
目标杂质分析
杂质研究过程中通常需要对药物中的已知或目标杂质进行分析，离子阱的选择反应监测（SRM）可对杂质特定的母离子和子离子进行扫描，保证结果的特异性和准确性，连续反应监测（CRM）更可对杂质特定的母离子，子离子和多级离子进行扫描，获得更高的灵敏度和抗干扰能力。下图中采用SRM 对目标化合物的母离子m/z 258 和子离子进行扫描，可看到在2.65min 有一明显色谱峰，在采用CRM 进一步对目标化合物的三级离子m/z 133 进行扫描后，2.65min 的化合物背景干扰明显降低，信噪比有了大幅提升。
图4. 多级质谱提供更高的特异性与灵敏度
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