抗原肽和MHC分子相互作用的特点

特定的MHC分子可凭借所需要的共用基序选择性地结合抗原肽，在这个意义上，两者的结合具有一定的专一性。由此推知，不同的MHC等位基因产物有可能提呈同一抗原分子的不同表位，造成不同个体（带有相互有别的MHC等位基因）对同一抗原应答强度的差异。这实际上是MHC以其多态性参与和调控免疫应答的一种重要机制。

深入研究发现，MHC分子对抗原肽的识别并非呈现严格的一对一关系，而是一种类型的MHC分子可以识别一群带有特定共同基序的肽段，由此构成MHC分子与抗原肽相互作用的包容性（flexibility）。这一包容性可表现在不同层次：首先，共同基序中以 ‘x’ 表示的氨基酸，其顺序和结构可以改变；其次，同一MHC分子（特别是Ⅱ类分子）所要求被提成肽段的锚定残基往往不止一种氨基酸，结果是，符合某一共同基序的肽段数量可以相当地多，造成一种MHC分子有可能结合多种抗原肽，活化多个抗原特异T细胞克隆；最后，不同MHC分子接纳的抗原肽，也可以拥有相同的共用基序。例如，在HLAⅠ类分子中至少已经确认了A2、A3、B4、B44四个家族，这些家族中的成员可选择性地共同识别拥有相同或相似锚定残基的抗原肽。这意味着，能够被某一HLA分子识别和提呈的抗原肽，也可被该家族其他分子所提呈。这一点，对应用肽疫苗或T细胞疫苗进行免疫预防和免疫治疗提供了便利。