有机元素分析仪是一种实验室常规仪器，其最基本的应用是化合物组成鉴定。分析误差来源包括系统误差和人为误差，造成误差的原因大致分为以下几点。
1、样品的选择问题 。样品在选择的时候酸的选择及浓度选择问题。酸浓度选择是另外一个关键问题，标准的浓盐酸约为12N，而有机元素分析样品处理过时，如果使用的酸太浓，不仅可能导致可溶有机碳的损失，而且清洗残余反应酸也非常费时，如果残留的酸清洗不干净，则可能对有机元素分析仪器造成伤害。
2、样品的采集保存问题。进行有机元素分析的地质样品在野外采集时必须遵循迅速采集、冷冻保存、防止人为污染等几个基本要求。采集的样品可以装在预先清洗干净的深色玻璃样品瓶中.冷冻低温保存，并尽快进行分析。
3.样品的重量问题。有机元素分析仪的分析误差还同分析样品的称量精度有关，在实验中必须有高精度的分析天平才能达到精准称量。
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