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反转录合成单链 cDNA 实验

2020.8.11
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

试剂、试剂盒 RNART主体混合液

仪器、耗材 薄壁PCR管离心管热循环仪

实验步骤

一、材料


1.核酸和寡核苷酸


来自方案2的RNA


为每个单独的H-T11M引物,分别配制RT主体混合液


蒸馏水                                28.2ul


5XRT缓冲液                       12.0ul


2.5mmol/LdNTP混合液        4.8ul


H-T11M(原文为H-T1M。一译者改)


引物(这里M=G、A或C)6.0ul


2.专用设备


0.5ml离心管


0.2ml薄壁PCR管(GenHunterT101)


热循环仪[推荐使用GeneAmpPCRSystem9600(Perkin-ElmerCorporation,Norwalk,CT)或者Mastercycler(EppendorfScientific,Westbury,NY)]


3.附加试剂


RNAspectraFluorescentmRNA差异显示系统(GenHunterF501-F510R501-R510),包括蒸馏水、5XRT缓冲液[125mmol/LTris-HCl、pH8.3,188mmol/LKCl,7.5mmol/LMgCl2,25mmol/L二硫苏糖醇(DTT)]、FDDdNTP混合液(2.5mmol/L)、锚定引物(H-T11M)(2umol/U以及MMLV逆转录酶(100U/ul)


二、方法


cDNA合成


1.按照下面步骤,配制3个反应管(为3种H-T11M引物各准备一个)。

各取42.5ulRT主体混合液,加到标记好的、无RNA酶的0.2ml薄壁PCR管中。记住要为所用的每个锚定引物(H-T11M)准备单独的RT反应!


2.用DEPC处理过的H20,将RNA稀释到终浓度并充分混匀,置于冰上。


3.取5.0ul稀释的RNA(0.1ug/ul),加到0.5ml管子中,并充分混匀。


4.按照下面程序设置热循环仪:65°C 5min→37°C 60min→75°C 5min →4°C平衡。


5.将反应管放到热循环仪中,开始程序。


6.当反应进行到37°C10min时,暂停热循环仪,在每个管中加入2.5ulMMLV逆转录酶,迅速混匀后继续温育。


7.反转录结束后,最高转速短暂离心,收集冷凝水。


8.将反应管放在冰上或-20°C备用。


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