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Sapphire与生命活动大事件-错配修复

2020.8.17
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qi

致力于为分析测试行业奉献终身

  【导读】

  错配修复(mismatch repair,MMR):在含有错配碱基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢复的修复方式;主要用来纠正DNA双螺旋上错配的碱基对。错配修复的过程需要区分母链和子链,做到只切除子链上错误的核苷酸,而不会切除母链上本来就正常的核苷酸,属于复制时修复。

  【背景知识】

  原核生物比如大肠杆菌的错配修复系统是由Mut基因编码的Mut S,Mut H和Mut L蛋白构成,其中Mut S和Mut L会形成四聚体Mut SL,在DNA上滑动,如果遇到碱基对错配引起的隆起,就会停留,开始把两边的DNA双链拉扯,成环,直到识别到GATC序列,如果A的N6发生甲基化,说明是母链,不切除,而如果GATC的A没有甲基化,说明是子链,Mut H就会结合在Mut SL上。Mut H有核酸内切酶活性,在GATC序列的5’端,也就是G的左边切开,再由DNase I发挥外切酶活性,把Mut SL四聚体拧出的环全部切除,再由DNA POL III和DNA连接酶重新填补。

  历史重构研究指出大肠杆菌使用EcMutS,EcMutL,EcMutH,EcUvrD,EcSSB和四个ssDNA核酸外切酶之一来实现切除。最近,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所有了新的发现。

  研究指出,最近的单分子图像揭示了EcMutS和EcMutL在错配的DNA上形成了级联的滑动夹,共同协助EcMutH在远程的新复制的GATC位点引入ssDNA断裂。研究人员已经成功可视化了完整的链特异性切除过程,并发现长寿命的EcMutL滑动夹在ssDNA断裂附近捕获了EcUvrD解旋酶,从而显著提高了其解链能力。在这一过程中,EcSSB调节EcMutL-EcUvrD解旋,并且这一过程很少伴随着广泛的ssDNA外切酶消化。这一结果与一种依赖于EcMut -EcUvrD解旋酶驱动的ssDNA片段在邻近EcMut-GATC切口之间的移位,并且与外切酶无关的MMR链切除机制一致。

  在这一研究中,科研人员通过美国Azure公司的SapphireTM双模式多光谱激光成像系统对核酸外切酶的活性进行了研究。

  对于大多数成像系统、需要在应用的灵活性和图像质量之间做选择。作为新一代实验室成像平台 ,SapphireTM Biomolecular Imager是新一代激光扫描成像系统,两者兼顾,具有无与伦比的灵活性、出色的灵敏度和图像质量。无论使用哪种应用,SapphireTM Biomolecular Imager和SapphireTM 采集软件都能够提供高质量的数据。

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  ◐ 蓝光检测和磷屏成像用PMT,近红外荧光检测使用APDs,可见光和化学发光用CCD 。

  ◐ 超宽动态范围,同时成像和定量低丰度和高丰度样品 。

  ◐ 图像分辨率可达10微米,实现高质量图像分析 。

  ◐ Sapphire Capture和AzureSpot软件,实现完美的成像和准确的分析。


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