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Northern Blot实验仪器试剂和方法步骤(2)

2020.9.07
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

7.探针的制备
1.在1.5ml离心管中配制以下反应液:
模板DNA(25 ng)     1ul
Random Primer 2ul
灭菌水 11ul
总体积:14ul
2.95°C加热3分钟后,迅速放置于冰冷却5min。
3.在离心管中按下列顺序加入以下溶液:
10×Buffer 2.5ul
dNTP Mixture 2.5ul
111 TBq/mmol[a-32P]dCTP 5 ul
Exo-free Klenow Fragment 1 ul
4.混匀后(25ul),37°C下反应30分钟。短暂离心,收集溶液到管底。
5.65°C加热5min使酶失活。
   
8.探针的纯化及比活性测定:
1.准备凝胶:将1g凝胶加入30ml的DEPC水中,浸泡过夜。用DEPC水洗涤膨胀的凝胶数次,以除去可溶解的葡聚糖。换用新配制的TE(PH7.6)。
2.取1ml一次性注射器,去除内芯推扞,将注射器底部用硅化的玻璃纤维塞住,在注射器中装填 Sephadex G-50凝胶。


3.将注射器放入一支15ml离心管中,注射器把手架在离心管口上。1600g离心4分钟,凝胶压紧后,补加 Sephadex G-50凝胶悬液,重复此步直至凝胶柱高度达注射器0.9ml刻度处
4.100ul STE缓冲液洗柱,1600g离心4min。重复3次。
5.倒掉离心管中的溶液后,将一去盖的1.5ml离心管置于管中,再将装填了 Sephadex G-50凝胶的注射器插入离心管中,注射器口对准1.5ml离心管。
6.将标记的DNA样品加入25 ul STE,取出0.5ul点样于DE8 paper上,其余上样于层析柱上。
7.1600g离心4min,DNA将流出被收集在去盖的离心管中,而未掺入DNA的dNTP则保留在层析柱中。取0.5ul己纯化的探针点样于DE8-paper.
8.测比活性(试剂比活要求:106cpm/ml)。 

9.预杂交:
1.将预杂交液在杂交炉中68℃预热,并漩涡使未溶解的物质溶解。
2.加入适当的ULRAhyb到杂交管中(以100cm2 膜面积加入10mlULRAhyb杂交液),42℃预杂交4 hr。

10.探针变性:
1.用10 mM EDTA将探针稀释10倍。
2.90℃热处理稀释后探针10min后,立即放置于冰上5min。
3.短暂离心,将溶液收集到管底。

11.杂交:
1.加入0.5ml ULTRAhyb到变性的探针中,混匀后,将探针加到预杂交液中。
2.42℃杂交过夜(14~24hr)。
杂交完后,将杂交液收集起来于-20℃保存。

12.洗膜:
1.低严紧性洗膜:加入Low Stringency Wash Solution#1 (100cm2膜面积加入20ml洗膜溶液),室温下,摇动洗膜5min两次。
2.高严紧性洗膜: 加入High Stringency Wash Solution#2 (100cm2膜面积加入20ml洗膜溶液),42℃ 摇动洗膜20min两次。

13.曝光:
1.将膜从洗膜液中取出,用保鲜膜包住,以防止膜干燥。
2.检查膜上放射性强度,估计曝光时间
3.将X光底片覆盖与膜上,曝光
4.冲洗X光底片,扫描记录结果。

14.去除膜上的探针:将200ml 0.1%SDS(由DEPC水配制)煮沸后,将膜放入,室温下让 SDS冷却到室温,取出膜,去除多余的液体,干燥后,可以保存几个月。

15.杂交结果

操作应该小心,但不必紧张。用于RNA电泳、转膜的所有器械、用具均须处理以除去RNAse 酶,以免样品的降解。转膜时,注意膜和多孔渗水屏之间不要有气泡


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