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双脱氧链终止法测定DNA序列实验原理、操作步骤和仪器...-2

2020.9.14
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

3.制备电泳凝胶及电泳

(1)制备胶模:取双块制胶玻板,先用泡沫海绵沾“洗洁净”液仔细擦洗,用水彻底淋洗,干燥后继用酒精清洗,晾干,再用硅烷剂(repel- silane)将玻板的—面擦一遍,蒸馏水淋洗,干燥 (注意:清洗时应戴一次性手套操作)。

将其中一块玻板平置台上(硅烷处理过的—面朝上),两侧各放置一条隔离条(最好选用上方厚为0.2mm,下方厚0.4mm的楔形条),另取—块玻板 (硅烷化处理过的—面朝下),对准放置在上述玻板上,两侧及—面边缘用胶带封严,并用文具夹夹紧,制成胶模。


(2)配制电泳凝胶:向1只100ml烧杯中加入下列试剂;20%丙烯酰胺溶液20ml;10×TBE缓冲液5ml;46.7%尿素溶液25ml。总体积50ml(凝胶的丙烯酰胺浓度为8%)。混匀,过滤除去不溶物,置100ml梨形瓶中连接水泵抽气5分钟,加入250μl 10%过硫酸铵,50μlTEMED混匀。

(3)注胶:立即将配好的凝胶用50ml注射器小心注入制好的玻板胶模中(胶模宜倾斜45度左右),注意防止气泡,如有气泡产生,可敲击该部位玻璃,使气泡上升排除。从上面插入梳齿背,深入胶面约10-12mm。将胶模水平放置45-60分钟,待凝胶聚合。

(4)电泳:凝胶聚合后,拨掉梳齿,撕去玻板下缘胶带,用蒸馏水淋洗凝胶表面,以除去未聚合物质。将胶板装置在电泳槽上,上下槽加入缓冲液,注意排除凝胶下缘气泡。接通电源,40W预电泳45-60分钟。预电泳结束后,断电。插入样品梳,梳齿向下插入凝胶中3mm左右。用缓冲液小心冲洗每一加样小槽 (齿间空隔),用记号笔标明A、G、C和T4个小槽,每槽加入变性后的链延伸/终止液1.5-2μl。接通电源,40W恒压,电泳至示踪染料溴酚蓝至底边时切断电源。如待测片段较长而需继续点样,则等示踪染料二甲苯腈蓝称至距下缘4-5cm时切断电源,用缓冲液冲洗另一组4个加样小槽(应与前一组相隔 1-2个加样小槽),重复上样操作,然后继续电泳至第2组示踪染料溴酚蓝移至玻板下缘时断电,停止电泳。

4.放射自显影及结果分析

将凝胶板自电泳槽取下后水平放置,小心分离两块玻板,让凝胶完好地留在其中一块玻板上。可将凝胶切下一小角以示方向。

在凝胶上小心地覆盖一张厚的3号新华滤纸,移去玻板,在凝胶另一面覆盖一张保鲜膜,注意排除气泡。滤纸面朝下置凝胶干燥器中干燥。


于暗室中,将干燥的凝胶的保鲜膜面与一张X光底片的药膜面贴合,夹在增感屏盒中,置70℃或室温曝光4-16小时,然后显影、定影(按所用显影及定影剂说明进行),水漂洗、干燥。然后由下而上读序。

[注意事项]

1.操作顺序参考表

(1)制备电泳凝胶(可在前一天下班前进行)。

(2)检查实验计划及试剂。

(3)预电泳。

(4)预电泳的同时进行引物退火、链延伸及终止反应。

(5)点样并电泳(根据需要可重复1-2次)。

(6)固定、干燥凝胶。

(7)放射自显影。

2.M13重组子的培养

(1)挑取单一的大肠杆菌集落加入3ml LB培养基中,37℃振荡培养直至A600光密度达到0.8-1.0为止。

(2)取200μl上述大肠杆菌培养物,加入含有2ml 2×YT培养基的试管中,再将插入待测DNA片段的M13单一白色噬菌斑接种其中,在37℃剧烈振荡培养至少5小时,但不宜超过8小时。

(3)通过两轮离心将细胞除去,第2轮的上清液小心转移至另一清洁试管中。存放4℃待用。


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