2 荧光显微镜和共聚焦激光扫描显微镜
一般以细胞核染色质的形态学改变为指标来评判细胞凋亡的进展情况。
常用的DNA 特异性染料有：HO 33342 (Hoechst 33342)，HO 33258 (Hoechst 33258), DAPI。三种染料与 DNA 的结合是非嵌入式的，主要结合在DNA 的A-T碱基区。紫外光激发时发射明亮的蓝色荧光。
Hoechst 是与DNA 特异结合的活性染料，储存液用蒸馏水配成1mg/ml 的浓度，使用时用PBS 稀释成终浓度为2~5mg/ml。
DAPI 为半通透性，用于常规固定细胞的染色。储存液用蒸馏水配成1mg/ml的浓度，使用终浓度一般为0.5 ~1mg/ml。
结果评判：细胞凋亡过程中细胞核染色质的形态学改变分为三期：Ⅰ期的细胞核呈波纹状（rippled）或呈折缝样（creased），部分染色质出现浓缩状态；Ⅱa 期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化；Ⅱb 期的细胞核裂解为碎块，产生凋亡小体。
3 透射电子显微镜观察
结果评判：凋亡细胞体积变小，细胞质浓缩。凋亡Ⅰ期（pro-apoptosis
nuclei）的细胞核内染色质高度盘绕，出现许多称为气穴现象（cavitations）的空泡结构(图2)；Ⅱa
期细胞核的染色质高度凝聚、边缘化；细胞凋亡的晚期，细胞核裂解为碎块，产生凋亡小体。
二、线粒体膜势能的检测
线粒体在细胞凋亡的过程中起着枢纽作用，多种细胞凋亡刺激因子均可诱导不同的细胞发生凋亡，而线粒体跨膜电位的下降，被认为是细胞凋亡级联反应过程中最早发生的事件，它发生在细胞核凋亡特征（染色质浓缩、DNA
断裂）出现之前，一旦线粒体DYmt 崩溃，则细胞凋亡不可逆转。线粒体跨膜电位的存在，使一些亲脂性阳离子荧光染料如Rhodamine 123、3
， 3-Dihexyloxacarbocyanine iodide[DiOC6 （ 3 ） ]
、Tetrechloro-tetraethylbenzimidazol carbocyanine iodide[JC-1]
、Tetramethyl rhodamine methyl
ester(TMRM)等可结合到线粒体基质，其荧光的增强或减弱说明线粒体内膜电负性的增高或降低。
方法：将正常培养的细胞和诱导凋亡的细胞加入使用终浓度为Rhodamine 123（1mM）或终浓度为DiOC6（25nM），JC-1（1mM），TMRM（100nM），37°C 平衡30min，
流式细胞计检测细胞的荧光强度。
三、DNA 片断化检测
细胞凋亡时主要的生化特征是其染色质发生浓缩, 染色质DNA 在核小体单位之间的连接处断裂, 形成50~300kbp 长的DNA 大片段,
或180~200bp 整数倍的寡核苷酸片段, 在凝胶电泳上表现为梯形电泳图谱(DNA
ladder)。细胞经处理后，采用常规方法分离提纯DNA，进行琼脂糖凝胶和溴化乙啶染色，在凋亡细胞群中可观察到典型的DNA
ladder。如果细胞量很少，还可在分离提纯DNA 后，用32P-ATP 和脱氧核糖核苷酸末端转移酶（TdT）使DNA
标记，然后进行电泳和放射自显影，观察凋亡细胞中DNA ladder 的形成。
1. 大分子染色体DNA 片段的测定
细胞凋亡的早期,染色体断裂成为50~300kbp 长的DNA 大片段。所有超过一定分子量大小的双链DNA
分子在琼脂糖凝胶中的迁移速度相同。线性DNA 的双螺旋半径超过凝胶半径时，即达到分辨力的极限。此时凝胶不再按分子量的大小来筛分DNA，DNA
像通过弯管一样，以其一端指向电场一极而通过凝胶，这种迁移模式称之为"爬行"。因此，细胞凋亡早期产生的50~300kbp 长的DNA
大片段不能用普通的琼脂糖凝胶电泳来分离。通常采用脉冲电泳技术可圆满地解决这一问题。这个方法是在凝胶上外加正交的交变脉冲电场。每当电场方向改变后，大的DNA分子便滞流在爬行管中，直至新的电场轴向重新定向后，才能继续向前移动。DNA分子量越大，这种重排所需要的时间就越长。当DNA
分子变换方向的时间小于电脉冲周期时，DNA 就可以按其分子量大小分开。
2． DNA Ladder 测定
方法：收获细胞（1X107）沉淀?细胞裂解液13000rpm′5min,
收集上清1%SDS和RnaseA（5mg/ml）56°C，2h。蛋白酶K（2.5mg/ml）37°C，2h，1/10 体积3M醋酸钠和2.5
倍体积的冷无水乙醇沉淀DNA，4°C过夜。14000rpm′15min最后将沉淀溶解在TE buffer中，加DNA Loading
Buffer 1.2%琼脂糖凝胶电泳，EB染色并照相。
3． 凋亡细胞DNA 含量的流式细胞计分析
方法：收集细胞，70%冷乙醇（in PBS）4°C 固定过夜，PBS 洗涤，1000rpm′10min RNase
A（0.5mg/ml）37°C 消化30min PI（50mg/ml）染色，室温避光15min，FACScan 分析DNA
亚二倍体的形成及细胞周期的变化。
4. ApoAlertTM LM-PCR Ladder Assay (CLONTECH)
优点：敏感度高，适合于检测少量样本，小部分凋亡细胞。如临床活组织检测。
四、TUNEL 法
细胞凋亡中, 染色体DNA 双链断裂或单链断裂而产生大量的粘性3'-OH
末端，可在脱氧核糖核苷酸末端转移酶（TdT）的作用下，将脱氧核糖核苷酸和荧光素、过氧化物酶、碱性磷酸酶或生物素形成的衍生物标记到DNA
的3'-末端，从而可进行凋亡细胞的检测，这类方法称为脱氧核糖核苷酸末端转移酶介导的缺口末端标记法（terminal
-deoxynucleotidyl transferase mediated nick end
labeling,TUNEL）。由于正常的或正在增殖的细胞几乎没有DNA 的断裂，因而没有3'-OH形成，很少能够被染色。TUNEL
实际上是分子生物学与形态学相结合的研究方法，对完整的单个凋亡细胞核或凋亡小体进行原位染色，能准确地反应细胞凋亡典型的生物化学和形态特征，可用于石蜡包埋组织切片、冰冻组织切片、培养的细胞和从组织中分离的细胞的细胞形态测定，并可检测出极少量的凋亡细胞，因而在细胞凋亡的研究中被广泛采用。
五、Caspase-3 活性的检测
Caspase 家族在介导细胞凋亡的过程中起着非常重要的作用， 其中caspase-3
为关键的执行分子，它在凋亡信号传导的许多途径中发挥功能。Caspase-3
正常以酶原（32KD）的形式存在于胞浆中，在凋亡的早期阶段，它被激活，活化的Caspase-3
由两个大亚基（17KD）和两个小亚基（12KD）组成，裂解相应的胞浆胞核底物，最终导致细胞凋亡。但在细胞凋亡的晚期和死亡细胞，
caspase-3 的活性明显下降。
1 Western blot 分析Procaspase-3 的活化，以及活化的Caspase-3 及对底物多聚（ADP-核糖）聚合酶[poly（ADP-ribose）polymerase，PARP]等的裂解。
方法：收集细胞→PBS 洗涤→抽提细胞裂解液→蛋白定量→SDS-PAGE 电泳→硝酸纤维素膜或PVDF
膜转移→5%脱脂奶粉封闭，室温1.5~2h 或4°C 过夜→Caspase-3 多抗或单抗室温反应1~2h 或4°C
过夜→TBS-T（含0.05% Tween 20的TBS）洗3 次，5~10min/次→HRP-标记的羊抗鼠IgG 或AP
标记的羊抗鼠IgG室温反应1~2h→ TBS-T 洗3 次， 5~10min/次→ECL 显影或NBT/BCIP 显色。
2 荧光分光光度计分析
原理：活化的Caspase-3 能够特异切割D1E2V3D4-X 底物，水解D4-X
肽键。根据这一特点，设计出荧光物质偶联的短肽Ac-DEVD-AMC。在共价偶联时，AMC不能被激发荧光，短肽被水解后释放出AMC，自由的AMC
才能被激发发射荧光。根据释放的AMC 荧光强度的大小，可以测定caspase-3 的活性，从而反映
Caspase-3 被活化的程度。
方法：收获细胞正常或凋亡细胞，PBS 洗涤，制备细胞裂解液加Ac-DEVD-AMC（caspase-3 四肽荧光底物），37°C 反应1h，荧光分光光度计（Polarstar）分析荧光强度（激发光波长380nm，发射光波长为430-460nm）。
3 流式细胞术分析
方法：收获细胞正常或凋亡细胞，PBS 洗涤，加Ac-DEVD-AMC 37°C 反应1hUV 流式细胞计分析caspase-3 阳性细胞数和平均荧光强度。
六、Annexin V 和PI 双染法
在本实验中，已经介绍了将荧光素标记的Annexin-V
作为荧光探针，利用流式细胞仪或荧光显微镜可检测细胞凋亡的发生。碘化丙啶(propidine iodide,
PI)是一种核酸染料，它不能透过完整的细胞膜，但在凋亡中晚期的细胞和死细胞，PI 能够透过细胞膜而使细胞核红染。因此将Annexin-V 与PI
匹配使用，就可以将凋亡早晚期的细胞以及死细胞区分开来。
由于凋亡是二十世纪细胞生物学的重要发现，其在医学生物学中具有非常重要的意义，因此检测细胞凋亡的方法也在不断地更新和发展中，除了我们以上介绍的方法，还有很多的新的凋亡检测手段，如凋亡相关蛋白TFAR19
蛋白的表达和细胞定位分析等，同学们如果有兴趣可以参考有关的书籍和资料。
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