应经常检查贮液器中活动相的量，加足活动相确保所有样品剖析完毕。输液管路上安装沉子至瓶底，贮液器盖上留一小孔正好夹住进液器，使其不能上下移动。
过滤器堵塞会引起管道和泵腔真空改变，使压力不稳。当过滤器被微粒所堵塞或长霉时，去掉过滤器后系统会工作正常，换上新的过滤器即可，有时候换上新过滤器仍然不畅，那么需要检查活动相的制备进程，或许换上大孔径流速过高、阻力大，形成真空化现象，这是因为过滤器孔径、管道内径、流速和溶剂粘度等引起的。假如流速大于10mL/min，常会呈现这种现象，试着用下列办法处理。
1、试用低流速，若问题处理了再进行下一步；
2、换大孔径的过滤器；
3、增加进液管内径；
4、举高或加压贮液器；
5、改低流速；
6、不用入口过滤器（但活动相一定要先过滤）。
7、当贮液器盖子太紧，在贮液器内形成真空，打出的活动相不连续。应松开盖子或留有1mm缝隙。
8、进液管路堵塞或曲折折叠会使泵抽不到液，留意调整进液路道或更新。
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