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肠道菌群的检测与筛选

2021.2.23
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

最近,在Nature上有一篇题为“The gutmicrobiota is associated with immune cell dynamics in humans”的研究报告中,科学家们通过研究揭示了机体微生物菌群与免疫系统之间的关联,研究人员首次发现,血液中不同类型免疫细胞浓度的改变或与肠道中不同菌群的存在直接相关。

 

近些年来,研究人员也发现,肠道菌群能够直接塑造人类机体免疫系统的组成,免疫系统和微生物菌群的平行恢复也给我们提供一个机会来分析这两个系统之间的关联;这些年,研究人员一直在定期收集并分析接受BMT患者的血液和粪便样本,结果表明,科学家们能从粪便中发现很多信息,并且通过样本观察其体内菌群在不断变化。Science, Nature等也相继报道肠道菌群的重要功能:肠道菌群为人体提供营养,调节代谢,调控肠道上皮发育和诱导先天性免疫,其功能相当于人体的一个重要的“器官”,破坏肠道菌群的平衡就是损害人的健康。

 

据统计,每个成人身上有约1.5公斤的细菌,它们分布在口腔、皮肤、呼吸道和肠道,其中肠道有约1公斤的细菌。肠道是人体与外界沟通的桥梁,又被称“第二大脑”,是最大的免疫器官,而肠道菌群又被称为“第八大器官”、“第二基因组”,种类有1000多种,总数达3×1014个,约为人体细胞数,编码的基因约为人体基因数的150倍。婴幼儿至老年肠道菌群呈稳态变化,肠道菌群多样性和数量也日趋成熟;需氧菌逐渐减少厌氧菌逐渐增多;因此,研究肠道菌群也就成为了人类健康问题研究中不可或缺的课题。
 

而在众多肠道菌中如何进行筛选培养有益菌便成为了研究的关键;

 

分离提取

 

 

在肠道微生物实验中,样品的分离提取是首要流程;INLABTEC均质袋能够轻松、便捷和高效的分离提取样品,其巧妙地设计使称样过程简单快速,有效降低称样与均质过程中的污染风险;侧口取液方式只需移液器无菌Tip嘴接触液面取样,避免了移液器过深插入均质袋引起污染;采用侧口内置滤膜技术,有效滤过均质液中的固态颗粒,显著减少菌落计数中的杂质误判。
 

样品稀释

 


提取的菌种液一般有很高的浓度,这时候需要对样品进行稀释接种,INLABTEC连续梯度稀释仪只需简单的按键操作,即可快捷精确地进行样品连续稀释;食品级无菌连续稀释袋代替试管,免除繁琐的实验前准备,大大节省了实验室储存试管等的空间;连续稀释袋边角45°设计,使样品快速均匀,无需繁琐易错的混匀操作。
 

高通量菌落筛选挑取

 

 

在微生物实验中,大规模的接种、筛选、挑取和复制常常是实验难以进行的瓶颈,ROTOR HDA是世界上速度最快、功能最强大的菌落自动化操作工作台,可在96、384、1536、6144密度下,对酵母、真菌、细菌及藻类的菌落进行高通量筛选与阵列重排;用ROTOR的6144密度的RePads针板,可在20秒内,将整个酵母缺失突变体库复制4次;可进行高通量酵母双杂交、遗传合成阵列(Synthetic Genetic Array)、表型或化学遗传分析。        Stinger是ROTOR HDA的功能延伸,可将固体或液体培养基中酵母、其他真菌、细菌、藻类方便、超快速地重排成高密度文库阵列。专门用于从96、384、1536、6144阵列密度的固体培养基上挑取和转接目标菌落。可按实验设计进行阵列式菌群混合制备,从而实现功能菌群筛选。在与PhenoBooth联合使用时也可以进行大规模的微生物菌株分选,将微生物完美传代。
 

大规模接种培养

 

 

肠道菌群一般都生活在厌氧的环境中,ELECTROTEK厌氧/微需氧工作站为厌氧/微需氧微生物的接种、分离和培养提供无氧/低氧环境,特别适用于志贺氏菌、杆菌、梭菌、乳酸菌等的培养和操作。

 

ELECTROTEK厌氧/微需氧工作站内腔正压设计,避免外接空气渗入;裸手操作,快捷省气,无需真空泵进行抽气式操作;内置定向气道技术,强制对流循环,保障内腔温度、湿度与气体浓度均一稳定;内置防溅PUD防爆电源插头,支持接入外部设备,完善的报警/指示系统,让实验更安全;长效除氧Super-Pd钯催化剂,高效除氧,无需烘干操作,寿命更长;可选配高/低温培养小室,可同时培养嗜热菌、嗜冷菌;支持个性化定制设计,完全满足客户要求。

 

在肠道菌研究技术迅速发展的今天,针对菌群微生物筛选培养的研究方法仍具有不可替代的优势,微生物的分离与培养仍是微生物学领域公认的首要科学任务。而肠道菌群的研究对解决人类疾病等健康问题具有很大的现实意义。


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